Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  302  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101354254--101354343
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17
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20
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1
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1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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22
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19
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9
38
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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44
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
45
1.82
101529420--101529469
16
2.8
18
82
17
61
66
0
2
32
1.03
101529422--101529469
25
1.9
25
86
0
69
66
0
2
31
1.03
101532125--101532265
27
5.2
27
78
11
146
35
23
22
18
1.96
101532125--101532265
54
2.6
54
89
2
203
35
23
22
18
1.96
101537614--101537659
22
2.1
22
87
0
65
32
13
4
50
1.61
101552394--101552435
20
2.0
21
86
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59
42
4
0
52
1.22
101554535--101554560
11
2.4
11
100
0
52
84
0
0
15
0.62
101554533--101554563
16
2.0
15
93
6
53
83
0
0
16
0.64
101555955--101556005
25
2.0
25
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0
93
23
9
27
39
1.86
101556289--101556314
6
4.3
6
100
0
52
30
0
0
69
0.89
101558646--101558722
13
5.9
13
82
0
91
29
9
24
36
1.86
101560114--101560161
24
2.0
24
95
0
87
29
14
8
47
1.73
101562398--101562495
49
2.0
49
82
4
117
26
14
27
31
1.95
101562859--101562973
49
2.3
48
81
14
128
31
25
18
25
1.97
101574160--101574207
24
2.0
24
95
0
87
18
16
18
45
1.85
101582768--101582800
8
4.2
8
92
7
59
51
24
0
24
1.48
101584073--101584124
16
3.6
16
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30
53
51
0
1
46
1.12
101584068--101584128
26
2.3
26
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0
104
54
0
1
44
1.10
101584061--101584115
26
2.2
24
84
12
83
54
0
0
45
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
13
100
0
50
48
16
0
36
1.46
101587433--101587481
10
4.9
10
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0
62
24
8
2
65
1.31
101588242--101588280
14
2.7
15
84
11
55
12
7
5
74
1.20
101589538--101589597
28
2.1
29
84
3
77
45
3
21
30
1.68
101593147--101593184
19
2.0
19
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10
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21
7
0
71
1.11
101599674--101599737
31
2.0
32
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3
121
25
6
15
53
1.65
101603383--101603457
28
2.7
29
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17
4
0
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0.90
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1
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101605894--101605925
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1.71
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1.9
18
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5
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29
11
2
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1.50
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20
2.2
20
100
0
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20
20
38
20
1.94
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1.9
24
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0
65
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13
17
34
1.88
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3.9
72
71
6
210
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11
17
35
1.86
101611654--101611962
46
6.6
46
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185
33
10
18
37
1.85
101611692--101611772
24
3.4
24
82
0
99
35
9
18
35
1.84
101611547--101611847
141
2.1
141
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1
406
34
11
17
36
1.86
101611884--101611985
24
4.3
24
69
9
84
33
9
19
37
1.85
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54
10.3
54
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5
442
38
12
22
26
1.90
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108
5.1
108
80
4
528
39
12
21
26
1.89
101612022--101612573
162
3.4
161
78
5
555
39
12
21
26
1.89
101617910--101617959
18
2.8
17
84
6
55
68
2
0
30
1.01
101619900--101619940
22
1.9
21
85
5
55
70
0
12
17
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101624946--101624985
21
1.9
20
85
10
53
57
7
0
35
1.27
101626470--101626507
10
3.8
10
83
13
51
65
2
7
23
1.32
101627172--101627354
97
1.9
97
86
2
260
31
23
14
30
1.94
101628219--101628257
5
8.0
5
88
5
53
61
0
2
35
1.10
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39
3.2
39
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0
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25
22
1.98
101637584--101637673
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2.4
38
84
0
108
23
21
26
28
1.99
101637677--101637823
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43
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0
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9
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1.87
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2.3
27
97
0
117
6
23
34
34
1.81
101638188--101638295
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2.5
42
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8
119
24
24
25
25
2.00
101641876--101641923
19
2.5
20
80
10
55
66
2
8
22
1.29

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362