Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  151  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
49981214--49981267
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3.0
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28
2
52
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.9
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27
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1.96
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26
26
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1.97
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27
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0.82
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22
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2.0
22
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25
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1.76
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1.42
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42
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1
185
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14
10
33
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9
28
39
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
50087552--50087623
33
2.2
33
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29
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26
1.98
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8
2
17
1.25
50097611--50097667
11
5.5
10
73
22
55
77
1
17
3
1.00
50097611--50097667
5
11.0
5
77
17
55
77
1
17
3
1.00
50097611--50097667
16
3.7
14
80
17
60
77
1
17
3
1.00
50097715--50097746
12
2.7
12
95
0
55
46
12
12
28
1.78
50100093--50100137
14
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14
78
6
56
35
0
15
48
1.45
50101111--50101170
29
2.1
29
93
0
102
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30
0
28
1.56
50101117--50101164
15
3.3
15
73
5
53
43
27
0
29
1.55
50103345--50103394
15
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15
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38
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40
1.76
50104755--50104795
15
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16
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7
26
0
65
1.18
50105898--50105973
29
2.4
32
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12
104
9
11
2
76
1.12
50106020--50106063
12
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11
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8
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11
2
4
81
0.92
50106019--50106063
13
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4
82
0.91
50108223--50108268
18
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19
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2
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1.28
50111886--50111948
33
1.9
33
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12
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12
26
6
53
1.62
50111945--50112001
14
4.2
13
77
20
62
10
17
0
71
1.12
50111945--50112002
27
2.1
27
87
12
84
10
18
0
70
1.15
50111963--50112066
18
5.6
18
73
10
84
6
18
3
71
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
50111963--50112070
6
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6
70
5
74
6
18
3
71
1.23
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81
1.9
83
80
6
181
9
20
2
67
1.30
50113192--50113216
11
2.3
11
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0
50
8
8
8
76
1.18
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30
3.2
30
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2
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15
26
28
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2.1
37
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0
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24
1.98
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49
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30
7
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1.85
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0
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14
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0
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0
2
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2.7
22
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0
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4
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24
0
3
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2.1
29
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0
102
41
30
0
28
1.56
50131712--50131759
15
3.3
15
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5
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43
27
0
29
1.55
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44
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0
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4.8
49
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29
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1.98
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101
2.5
99
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2
323
28
27
18
25
1.98
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2.9
47
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189
31
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1.98
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30
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29
22
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1.95
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1.9
18
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20
0
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1.23
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18
2.8
18
90
0
75
7
13
3
74
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
50150220--50150273
6
9.2
6
75
4
56
5
14
3
75
1.12
50150169--50150273
12
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12
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17
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8
17
2
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1.23
50151362--50151421
13
4.5
13
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20
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5
5
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75
1.13
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10
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5
82
0.94
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2.4
22
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5
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1.03
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1.74
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21
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1.74
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1.96
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21
2.1
20
86
4
59
41
18
18
20
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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