Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  61  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18601854--18601955
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2.2
47
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3
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14
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18601925--18601981
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15
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2.0
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1.9
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27
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1.8
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1.98
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2.3
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4.3
44
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29
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112
52
2
0
45
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18658387--18658496
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26
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5
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18660114--18660228
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23
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1.93
18660114--18660228
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2.1
54
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21
23
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1.93
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38
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2.0
29
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20
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2.0
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1.98
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474
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29
18
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1.98
18702884--18702922
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2.0
20
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18706558--18706614
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3.4
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7
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0
3
59
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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1.98
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0
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
18750468--18750501
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0
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1.63
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235
34
5
14
45
1.68
18753018--18753167
72
2.1
73
92
5
259
34
6
14
46
1.69
18753078--18753141
20
3.3
20
72
12
71
32
6
15
45
1.71
18753064--18753161
17
5.4
17
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13
61
32
4
15
47
1.64
18753166--18753240
9
8.4
9
86
2
107
22
13
21
42
1.87
18754890--18754930
21
2.0
21
95
0
73
31
31
14
21
1.94
18756600--18756632
16
2.1
16
88
11
50
45
0
15
39
1.46
18757844--18757872
14
2.1
14
100
0
58
48
0
31
20
1.50
18762491--18762533
16
2.7
16
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0
68
51
20
20
6
1.71
18762491--18762533
8
5.4
8
80
0
50
51
20
20
6
1.71
18762746--18762835
29
3.1
28
85
7
119
25
13
31
30
1.94
18764622--18764702
39
2.1
39
90
0
126
33
4
19
41
1.73
18779069--18779142
37
2.0
37
100
0
148
37
8
8
45
1.63
18780039--18780077
10
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10
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2
0
33
1.08
18780031--18780086
11
4.9
11
79
14
60
60
3
0
35
1.14
18780039--18780095
21
2.6
21
83
5
60
61
3
0
35
1.13
18780081--18780118
19
2.1
18
90
5
58
55
2
0
42
1.14
18785574--18785849
27
10.3
27
83
3
270
25
19
21
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18785574--18785849
54
5.1
54
84
2
304
25
19
21
34
1.96
18785849--18786048
27
7.4
27
90
0
310
25
21
20
33
1.97
18785809--18785889
40
2.0
40
87
0
117
25
17
16
40
1.89
18785782--18785916
67
2.0
67
86
0
189
25
18
17
38
1.92
18785729--18785970
121
2.0
121
89
1
369
24
19
19
36
1.95
18789646--18789700
28
2.0
28
85
0
74
29
25
21
23
1.99
18790102--18790457
27
13.1
27
86
0
478
23
22
21
32
1.98
18799293--18799321
14
2.0
15
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24
34
6
34
1.82
18800823--18800875
25
2.2
24
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3
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56
5
5
32
1.46
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9
5.1
9
78
12
51
68
0
0
31
0.90
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20
3.4
20
80
19
67
63
0
1
35
1.03
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24
3.9
23
71
20
77
60
3
2
34
1.25
18809968--18810030
23
2.7
23
90
0
99
19
23
20
36
1.95
18811885--18812111
48
4.8
48
75
9
225
26
19
25
28
1.99
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2.7
84
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0
430
30
4
23
41
1.75
18816898--18817146
90
2.8
90
83
2
295
36
15
23
24
1.94
18826532--18826573
19
2.3
19
91
4
68
66
0
33
0
0.92
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170
2.0
172
92
3
579
19
21
22
36
1.95
18833027--18833068
19
2.3
19
91
4
68
66
0
33
0
0.92
18839158--18839197
19
2.1
19
90
0
62
57
2
40
0
1.12
18840277--18840315
6
6.5
6
93
0
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17
15
15
51
1.77
18840282--18840321
18
2.2
18
86
0
53
17
20
12
50
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18842511--18842557
25
1.9
24
82
4
58
27
2
2
68
1.13
18855147--18855371
40
5.7
40
90
1
303
26
27
23
22
1.99
18858231--18858354
47
2.6
47
83
5
169
30
29
15
24
1.95
18875462--18875593
47
2.8
47
89
3
203
34
26
16
22
1.95
18880227--18880357
47
2.8
47
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3
183
33
25
14
25
1.94
18891480--18891679
51
3.9
51
90
1
285
29
25
14
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1.94
18891702--18891904
28
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27
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237
25
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1.92
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24
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1.92
18891718--18891904
52
3.6
52
95
0
329
25
21
14
37
1.92
18902209--18902241
16
2.0
17
88
5
50
21
27
12
39
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362