Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  25  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7293249--7293350
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3
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1.28
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4
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20
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0
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2.0
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7297071--7297275
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2.0
102
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0
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2.0
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2.2
22
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10
7.0
10
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4
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1.26
7329294--7329364
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2.3
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1
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1.26
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1.26
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50
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0
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0.84
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1.9
25
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73
2
20
0
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0.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.4
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62
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0
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2.0
24
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0
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18
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2.0
22
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0
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40
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21
2.2
22
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62
31
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62
1.20
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2.1
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150
2.2
151
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337
35
13
20
30
1.91
7411596--7411784
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5.2
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15
113
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2.0
16
100
0
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68
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50
64
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1.14
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2.2
29
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1
18
1.59
7424113--7424165
14
3.7
14
76
14
54
47
33
1
16
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.50
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134
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8
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34
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15
27
1.95
7424690--7425062
132
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131
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2
579
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24
14
26
1.93
7424958--7425153
91
2.2
91
90
1
304
33
23
15
27
1.95
7425074--7425292
120
1.8
120
85
3
307
32
24
15
27
1.96
7427199--7427238
21
1.9
21
89
0
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2
2
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1.9
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21
1.93
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2.2
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1.94
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0
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5
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2.1
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1
3
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13.2
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10
3
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1.48
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12
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29
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4
54
1.56
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3
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9
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27
5
3
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1.36
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19
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16
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10
0
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19
28
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1.98
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9
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28
1.87
7456885--7456965
32
2.5
32
84
4
101
35
8
25
29
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7459548--7459612
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2.3
28
83
0
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1.83
7459685--7460012
39
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39
83
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412
19
22
28
29
1.98
7459813--7459867
27
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0
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18
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9
250
19
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29
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45
4.3
44
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5
109
33
23
21
21
1.97
7473524--7473565
14
3.0
14
76
10
50
50
30
16
2
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18
1.9
19
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5
56
47
0
2
50
1.15
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29
3.1
28
73
15
74
30
9
3
56
1.47
7477180--7477280
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24
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19
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2
3
62
1.28
7479001--7479131
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2.8
46
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3
156
33
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19
21
1.97
7491248--7491374
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2.7
46
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150
30
25
20
23
1.98
7497599--7497659
30
2.0
30
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6
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44
11
8
36
1.71
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13
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13
100
0
50
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0
0
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5
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1.50
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19
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37
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29
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1.98
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19
2.4
18
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2
2
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2.0
43
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0
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11
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17
2.3
17
86
13
53
60
2
2
34
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
22
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27
0
0
72
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20
2.7
20
80
8
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67
9
1
20
1.28
7534262--7534300
21
1.9
20
89
5
60
61
10
2
25
1.41
7534245--7534319
19
3.9
18
79
10
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10
1
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1.35
7534245--7534320
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0
0
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0
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25
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9
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25
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46
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24
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7587612--7587922
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438
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24
15
37
1.93
7587612--7587922
137
2.3
130
87
6
428
22
24
15
37
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7587836--7587911
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38
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0
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0
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52
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41
85
5
484
23
19
29
27
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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