Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  259  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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21
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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10
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58
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.84
87630555--87630660
47
2.3
47
93
0
176
42
6
23
27
1.79
87635145--87635261
42
2.8
42
82
2
137
14
23
19
42
1.88
87639558--87639650
41
2.3
41
92
0
150
24
27
13
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1.94
87639558--87639619
21
3.0
21
65
11
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22
30
16
30
1.96
87639558--87639673
41
2.8
41
88
0
124
21
24
17
37
1.94
87647518--87647629
55
2.0
55
94
0
197
32
3
21
42
1.70
87652241--87652270
13
2.3
13
94
0
51
50
16
0
33
1.46
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28
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11
2
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1.52
87660645--87660687
22
2.0
22
90
0
68
51
37
2
9
1.47
87660929--87660966
17
2.3
17
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4
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36
0
2
60
1.11
87660913--87660966
8
7.0
8
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38
1
1
57
1.20
87668515--87668566
20
2.6
20
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0
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26
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1.98
87684002--87684070
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14
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7
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36
1.54
87684048--87684086
19
2.1
19
95
0
69
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10
2
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1.48
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24
2.2
24
89
0
77
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1.43
87688712--87688763
24
2.2
24
89
0
77
55
9
1
32
1.43
87688936--87689015
42
2.0
40
85
5
106
51
1
3
43
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
17
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60
3
0
36
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12
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12
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0
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0
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0.63
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2.2
30
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35
1
3
59
1.23
87695312--87695336
8
3.1
8
100
0
50
40
0
0
60
0.97
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13
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0
12
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1.10
87697672--87697709
19
2.0
20
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0
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1.12
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30
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31
1.28
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0
70
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0
0
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1.9
19
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0
0
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2.0
35
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87747509--87747535
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2.1
13
100
0
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0
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0
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0
0
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15
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13
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0
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2.0
59
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0
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19
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231
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20
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87770213--87770462
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3.1
79
82
5
281
34
14
20
30
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87770213--87770471
80
3.3
79
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265
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1.92
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0
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0
0
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0
0
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0
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20
0
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1.02
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54
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0
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3.5
46
89
1
236
40
14
23
22
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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