Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  327  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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109241391--109241503
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19
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0
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319
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46
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0
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30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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28
1.97
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2.0
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1.62
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9
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2
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3.2
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237
27
17
27
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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177
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24
24
1.98
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2.9
89
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19
22
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1.98
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1.97
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3.0
122
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474
29
19
22
28
1.98
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2.1
132
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415
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1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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56
1.37
109418640--109418887
50
4.8
50
85
5
302
26
23
29
20
1.99
109418640--109418888
100
2.4
102
87
7
353
26
23
29
20
1.99
109421769--109421800
12
2.6
12
95
5
55
25
6
3
65
1.31
109430616--109430673
30
1.9
30
89
0
89
41
3
24
31
1.71
109430885--109430916
13
2.5
13
94
0
55
31
0
12
56
1.37
109431011--109431252
50
4.7
50
86
4
297
26
24
29
19
1.99
109431011--109431260
100
2.4
103
88
6
364
26
24
29
20
1.99
109433132--109433177
25
1.9
25
82
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60
30
15
0
54
1.41
109433439--109433620
46
4.0
46
87
1
222
20
24
14
40
1.90
109436282--109436306
13
1.9
13
100
0
50
84
0
8
8
0.79
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6
12.5
6
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10
75
44
0
0
55
0.99
109437910--109437985
25
3.0
26
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5
104
47
0
0
52
1.00
109454271--109454305
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2.1
17
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28
0
2
68
1.04
109454290--109454345
22
2.6
21
82
5
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28
0
1
69
0.98
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2.0
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0
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13
1.82
109463188--109463293
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1.9
55
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160
50
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28
1.68
109467416--109467478
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2.0
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0
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2.0
22
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0
88
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13
40
1.84
109469494--109469577
18
4.6
18
80
1
78
36
9
9
44
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109469489--109469577
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2.4
37
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1
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35
10
11
42
1.74
109481706--109481774
35
1.9
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8
0
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2.0
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5
1
41
1.33
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30
1.9
30
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7
89
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1.73
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2
4
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1.29
109497763--109497820
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3.6
16
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62
3
5
29
1.33
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18
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6
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0
2
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1.02
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1.47
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147
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1
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100
0
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0
0
58
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109499937--109499993
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20
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1
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0
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0
10
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127
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0
36
36
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52
2
0
45
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15
2.9
15
82
10
52
52
0
0
47
1.00
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1
0
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1.10
109507861--109508342
120
4.0
120
95
0
752
51
4
1
42
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109507954--109508038
43
2.0
43
82
8
104
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2
1
42
1.21
109508135--109508318
37
4.7
37
70
17
140
51
3
1
44
1.27
109508118--109508271
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18
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54
2
0
42
1.19
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20
2.7
19
79
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59
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5
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34
1.42
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19
2.6
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2
0
44
1.12
109512071--109512107
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1.9
19
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51
2
0
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1.15
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3
18.0
3
79
11
56
64
5
0
30
1.17

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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