Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  26  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7612702--7612874
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90
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0
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21
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0
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29
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2.4
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20
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2.2
12
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0
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1.74
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5.1
41
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81
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20
23
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1.96
7628693--7628911
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5.4
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34
19
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1.96
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2.0
37
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1
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4.2
16
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12
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5
2
45
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63
25
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17
26
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22
2.1
22
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0
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15
4
13
67
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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43
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13
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9
21.0
9
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16
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48
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1
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1.54
7633391--7633610
52
4.3
52
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10
251
50
16
1
32
1.54
7633333--7633559
95
2.5
89
86
8
337
52
14
0
32
1.47
7633443--7633559
46
2.6
44
89
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191
52
15
0
30
1.48
7633353--7633590
95
2.5
94
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325
50
15
0
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1.49
7639127--7639177
21
2.4
21
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0
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29
19
49
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1.60
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2.5
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17
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2.2
20
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1
53
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1
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2.1
41
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17
2.0
17
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50
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3
6
75
1.11
7651487--7651522
18
2.0
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100
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10
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57
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1.48
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4.8
46
86
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37
15
25
21
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93
2.4
92
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279
38
15
25
20
1.91
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2.0
19
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53
0
0
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0
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2.0
21
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57
48
19
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1.49
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35
5.2
35
80
10
183
29
12
23
34
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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31
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1
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1.61
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12
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28
0
7
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1.20
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2.8
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1
144
37
18
22
21
1.94
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46
4.5
46
84
8
249
44
14
23
18
1.86
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89
1.9
89
93
0
287
45
13
23
17
1.83
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26
2.0
26
100
0
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22
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1.9
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15
22
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8
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17
29
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1.97
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2.2
17
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53
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0
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21
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31
1.98
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2.2
17
86
13
53
33
0
20
46
1.51
7718280--7718355
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0
143
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21
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1.98
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100
0
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11
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0
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12
2.6
12
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0
53
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41
29
29
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7756058--7756118
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2.7
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4
0
29
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2.1
16
94
5
57
56
6
0
37
1.25
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116
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113
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9
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52
15
1
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1.50
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112
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112
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569
52
15
0
30
1.49
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15
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0
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27
88
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77
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32
26
23
1.96
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12
2.2
12
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0
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0
0
15
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7758217--7758255
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2.0
20
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0
69
82
0
2
15
0.79
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13
2.1
14
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51
3
0
44
1.18
7767316--7767364
24
2.0
24
100
0
98
16
42
16
24
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7776713--7776804
42
2.2
42
94
0
157
17
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29
15
1.90
7781244--7781361
47
2.5
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132
28
18
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22
1.98
7781835--7781868
7
4.9
7
100
0
68
0
41
0
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14
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1.40
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0
0
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0
0
6
0.35
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26
2.0
26
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40
19
7
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1.80
7816225--7816260
16
2.2
16
100
0
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19
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1.83
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93
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2
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21
24
14
39
1.91
7819938--7820289
46
7.6
46
87
1
454
21
23
14
40
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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139
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0
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23
15
40
1.91
7825571--7825621
25
1.9
28
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11
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1
19
27
1.58
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5.2
5
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0
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19
0
0
0.71
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29
2.7
31
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11
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3
7
39
1.49
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1.53
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3.0
20
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1.55
7834111--7834184
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2.8
27
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1.52
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0
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0
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1.98
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1.8
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29
1.98
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19
2.0
20
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27
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3.0
30
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15
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15
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27
26
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26
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27
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0
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0
15
10
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7895911--7895992
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13.2
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22
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0
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0
25
0
0.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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