Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  130  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
43108514--43108696
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27
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3.8
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117
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22
28
24
1.99
43108567--43108733
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2.1
79
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4
194
24
20
28
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1.99
43116396--43116579
40
4.6
40
82
6
196
23
20
27
28
1.99
43116396--43116576
80
2.3
81
83
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221
23
20
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27
1.99
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20
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26
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21
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29
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2.0
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0
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1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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23
21
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26
1.99
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2.3
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2
2
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1.12
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2
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1.13
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6
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0
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40
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0
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2.0
24
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43185553--43185664
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2.1
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23
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51
2.0
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24
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2.0
23
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28
20
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1.8
93
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29
20
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1.98
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4.4
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11
89
60
12
15
10
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
43212137--43212353
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5.5
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23
29
24
1.99
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45
75
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158
28
29
20
21
1.98
43213898--43214069
93
1.8
93
88
0
263
27
29
20
22
1.99
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23
2.0
23
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23
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1.94
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54
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37
22
23
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1.94
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133
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2.0
23
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13
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30
1.93
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2.0
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21
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1.59
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10
387
55
14
1
28
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
43297423--43297656
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3.1
76
81
5
276
53
15
0
29
1.48
43297423--43297656
76
3.1
76
81
5
267
53
15
0
29
1.48
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2.7
19
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58
0
2
39
1.10
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5
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33
21
21
23
1.97
43299742--43299789
19
2.5
18
80
10
51
20
41
22
14
1.89
43306192--43306403
47
4.6
44
69
14
135
23
30
19
26
1.98
43307111--43307135
12
2.1
12
100
0
50
60
16
8
16
1.58
43311653--43311713
30
2.0
30
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0
77
29
26
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37
1.81
43324604--43324855
88
3.1
76
79
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245
26
0
16
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1.41
43324604--43324775
76
2.2
78
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10
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27
0
16
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1.40
43324687--43324855
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1.9
89
95
2
304
26
0
17
56
1.42
43324777--43325067
102
2.8
104
87
9
429
28
0
15
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1.39
43325045--43325081
17
2.3
16
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0
5
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1.18
43333727--43333751
5
5.0
5
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0
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20
0
0
0.72
43333788--43333821
12
2.8
12
95
0
59
20
20
32
26
1.97
43334727--43334974
132
1.9
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4
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32
12
15
39
1.85
43335300--43335499
26
7.9
26
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26
1.40
43335304--43335369
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30
1.41
43335336--43335501
50
3.3
50
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24
1.40
43335422--43335491
28
2.5
28
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2
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27
1.30
43335473--43335555
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2.4
36
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13
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65
6
2
26
1.28
43335612--43335688
25
3.0
26
76
16
88
63
3
5
27
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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40
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0
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11
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36
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5.0
77
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77
3.0
85
84
9
357
24
8
10
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1.63
43337497--43337631
42
3.1
43
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16
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24
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10
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162
2.0
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0
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1.63
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2.5
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28
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1.62
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0
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0
0
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100
0
106
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0
0
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17
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0
24
1.10
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15
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0
10
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1.28
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2.1
12
100
0
50
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0
0
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2.1
21
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0
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0
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20
26
1.46
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9
5.6
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50
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0
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43354024--43354073
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18
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0
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0
22
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1.53
43354136--43354252
9
12.3
9
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1.63
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2.0
57
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154
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1
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1.63
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10
100
0
58
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0
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183
2.0
183
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15
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14
2.2
13
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5
51
36
13
0
50
1.42
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37
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24
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15
1.82
43357272--43357322
24
2.1
25
85
3
68
27
3
31
37
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
43362184--43362616
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47
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2
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31
9
30
28
1.88
43362187--43362614
192
2.2
192
92
2
713
31
9
31
28
1.88
43362184--43362616
143
3.0
142
91
3
681
31
9
30
28
1.88
43362735--43362813
37
2.1
37
90
0
122
24
18
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25
1.98
43365638--43365676
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2.8
14
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2
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18
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0
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40
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16
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35
1.90
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22
3.3
22
63
22
55
35
22
6
35
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362