Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  38  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.2
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93
0
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0
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29
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26
1.99
11261786--11262037
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2.5
13
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0
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56
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0
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1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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47
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2.0
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33
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22
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0
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1.93
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5.8
31
90
2
254
28
19
26
25
1.99
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2.0
30
96
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15
23
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25
28
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11329140--11329255
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2.7
43
84
4
146
31
15
24
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.4
16
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60
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2
15
0.80
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21
28
28
1.98
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93
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22
21
29
27
1.99
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27
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205
29
28
15
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1.96
11374769--11374924
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1.9
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233
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28
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28
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24
2.0
23
83
4
58
14
21
14
48
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11401115--11401169
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24
36
1.93
11405167--11405323
46
3.3
47
72
13
160
15
22
24
36
1.94
11406729--11406784
28
1.9
30
85
7
80
39
21
1
37
1.64
11406997--11407031
17
1.9
18
88
11
54
0
31
0
68
0.90
11407069--11407115
21
2.2
21
85
11
60
23
8
2
65
1.31
11407164--11407206
19
2.2
20
80
8
54
34
6
2
55
1.39
11413169--11413208
17
2.4
17
95
0
71
35
27
27
10
1.89
11434037--11434279
5
48.2
5
90
1
369
56
0
3
39
1.23
11434436--11434509
32
2.3
32
88
0
112
39
16
1
43
1.56
11434674--11434808
40
3.4
40
65
9
98
34
23
14
27
1.94
11435691--11435737
21
2.2
22
88
11
71
23
8
0
68
1.17
11435698--11435732
16
2.2
16
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0
52
22
8
0
68
1.16
11438886--11438943
30
1.9
30
85
0
80
15
24
37
22
1.93
11442626--11442704
27
3.0
26
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22
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60
2
32
3
1.28
11448605--11448773
93
1.8
92
92
3
286
28
21
23
27
1.99
11448698--11448803
41
2.6
41
98
0
203
28
21
22
27
1.99
11449018--11449115
33
2.9
33
84
7
108
30
10
22
36
1.87
11452077--11452306
123
1.9
123
90
3
374
28
21
22
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11452069--11452306
41
5.8
41
86
7
331
28
21
22
27
1.99
11452069--11452306
82
2.9
82
93
2
390
28
21
22
27
1.99
11452523--11452620
33
2.9
33
84
7
108
30
10
22
36
1.87
11453494--11453546
26
2.0
27
85
7
74
24
15
22
37
1.92
11455031--11455086
26
2.2
26
96
0
103
33
28
7
30
1.84
11458669--11458726
30
1.9
30
85
0
80
17
25
36
20
1.94
11463545--11463690
12
12.0
12
71
15
52
29
2
4
63
1.27
11463596--11463693
26
3.9
25
75
24
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30
3
2
64
1.20
11463630--11463718
3
29.3
3
72
22
62
32
4
1
61
1.23
11463595--11463718
27
4.5
26
75
18
94
31
4
1
62
1.23
11463598--11463658
15
4.4
14
76
19
74
31
1
1
65
1.12
11463598--11463691
12
7.5
12
70
21
68
30
3
2
63
1.21
11463631--11463718
35
2.5
35
82
12
101
32
4
1
61
1.24
11463769--11463993
109
2.1
109
98
0
432
42
8
3
46
1.50
11474997--11475035
8
4.6
8
84
9
51
82
0
0
17
0.68
11474994--11475035
17
2.3
18
88
8
59
80
0
0
19
0.70
11475850--11476518
44
15.3
43
70
12
348
31
14
26
27
1.95
11475844--11476449
132
4.7
132
81
9
622
32
14
26
26
1.95
11476350--11476558
45
4.7
45
72
13
171
32
16
25
25
1.96
11476237--11476540
134
2.3
134
89
1
468
31
16
25
26
1.96
11478017--11478110
12
7.5
12
74
19
77
31
3
2
62
1.22
11478017--11478110
27
3.8
24
71
21
77
31
3
2
62
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11478049--11478135
3
28.3
3
73
21
65
33
4
1
60
1.24
11478017--11478077
15
4.4
14
80
12
81
32
1
1
63
1.13
11484017--11484072
15
3.7
15
85
0
85
23
23
25
28
1.99
11484078--11484141
24
2.7
24
75
0
65
39
15
14
31
1.87
11484192--11484262
15
4.9
15
76
11
67
23
21
25
29
1.99
11484197--11484262
29
2.2
30
81
5
80
22
19
27
30
1.98
11484367--11484684
34
9.4
34
85
0
402
32
17
16
32
1.93
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7
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10
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2.5
43
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6
124
31
23
17
27
1.97
11487334--11487368
10
3.4
10
92
7
61
8
11
2
77
1.10

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362