Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  333  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111016318--111016433
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111021359--111021416
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0
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0
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50
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28
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0
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0
0
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2.0
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3.0
92
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30
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17
75
10
54
55
0
11
33
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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20
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35
1.27
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93
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0
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50
81
0
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126
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30
14
15
38
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2.4
20
82
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62
62
0
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33
1.14
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100
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52
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16
16
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20
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0
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2.0
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78
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2
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2.0
19
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50
2
0
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20
29
29
1.97
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103
2.6
104
90
3
419
19
20
29
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111140422--111140466
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4
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0
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0
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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2.0
20
85
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53
35
10
5
48
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100
0
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66
0
0
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0
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68
34
0
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59
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0
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1.9
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1.98
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1.9
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5
141
33
22
15
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.5
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28
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25
32
1.92
111209873--111210000
57
2.2
57
88
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186
28
12
25
32
1.92
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29
4.5
28
88
2
175
32
25
12
28
1.92
111212712--111212840
57
2.3
57
87
2
188
32
26
12
28
1.92
111219194--111219243
23
2.2
23
92
0
82
38
6
4
52
1.45
111221311--111221349
14
2.6
15
84
12
53
71
2
0
25
0.98
111221308--111221350
22
2.0
22
81
9
52
72
2
0
25
0.97
111227271--111227303
16
2.0
17
88
5
50
57
0
0
42
0.98
111230410--111230439
4
7.8
4
92
7
53
73
0
26
0
0.84
111237549--111238490
313
3.0
313
99
0
1877
20
20
21
38
1.94
111240540--111240599
29
2.1
29
96
3
113
61
3
6
28
1.37
111241457--111241535
39
2.0
39
100
0
158
49
7
10
32
1.65
111242233--111242272
20
2.0
20
85
5
53
47
7
7
37
1.60
111242367--111242427
24
2.4
27
76
15
67
59
3
0
37
1.14
111244345--111244382
17
2.1
19
90
9
62
55
5
13
26
1.59
111245079--111245126
20
2.5
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10
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2
6
25
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111245113--111245156
17
2.4
18
77
14
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56
9
0
34
1.31
111245151--111245180
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2.0
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0
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0
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2.0
21
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0
77
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13
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13
1.46
111257864--111257927
28
2.2
30
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5
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1
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1.51
111258920--111258964
22
2.0
22
86
0
63
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8
8
26
1.60
111265423--111265490
24
2.8
24
76
10
75
47
19
16
17
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111265432--111265491
24
2.5
24
86
2
84
48
20
15
16
1.81
111277651--111277695
22
2.0
22
82
4
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44
2
8
44
1.47
111286317--111286354
19
1.9
19
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15
51
39
18
2
39
1.65
111301899--111301940
22
1.9
22
85
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7
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40
1.65
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23
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15
19
24
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1.90
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5
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5
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0
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27
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1.21
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2.0
20
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2
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1.57
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8
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60
2
2
35
1.20
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16
2.1
16
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0
50
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0
2
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1.05
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2.9
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0
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20
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1.63
111316915--111317081
39
4.3
39
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275
38
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25
13
1.91
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9
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0
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43
0
5
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1.24
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0
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0
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2.0
19
100
0
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15
47
1.82
111341307--111341331
13
1.9
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100
0
50
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8
4
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1.47
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2.2
33
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7
94
31
0
12
55
1.37
111352114--111352157
19
2.2
21
88
8
65
11
22
20
45
1.83
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130
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442
35
17
18
28
1.94
111361449--111361489
18
2.2
19
83
12
50
46
0
4
48
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111361970--111362101
69
1.9
69
98
0
255
40
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10
30
1.85
111365459--111365496
15
2.5
15
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16
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31
0
2
65
1.06
111367180--111367242
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2.1
30
93
0
108
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1.47
111372796--111372865
31
2.3
30
80
9
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4
4
47
1.42
111373155--111373193
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2.0
20
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0
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0
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0
0
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1.43
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19
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17
2.4
17
86
0
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32
2
5
60
1.32

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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