Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  280  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94474244--94474427
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43
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29
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1.8
140
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30
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89
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34
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
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T
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26
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2.9
27
79
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35
2
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1.18
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2.0
44
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40
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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26
2.5
27
79
13
70
65
8
0
26
1.21
94675607--94675649
16
2.9
15
86
10
61
65
11
0
23
1.25
94675607--94675649
14
2.9
16
86
10
56
65
11
0
23
1.25
94678775--94678803
11
2.6
11
100
0
58
27
13
37
20
1.91
94680524--94680716
103
1.9
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237
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1
29
1.50
94680498--94680768
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98
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11
276
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15
0
30
1.48
94681075--94681104
3
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3
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7
53
0
30
0
70
0.88
94683265--94683300
18
1.9
19
94
5
65
66
0
2
30
1.06
94706266--94706296
15
2.1
15
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0
53
19
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1.62
94710893--94710920
7
4.0
7
100
0
56
42
0
0
57
0.99
94711429--94711488
3
20.0
3
77
13
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66
1
28
3
1.17
94712684--94712727
11
3.9
11
79
5
52
36
0
2
61
1.09
94714801--94715112
46
7.0
46
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37
15
24
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1.93
94714811--94715068
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2.9
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5
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36
15
25
22
1.94
94718047--94718091
11
3.9
11
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11
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35
0
2
62
1.08
94720231--94720400
46
4.0
39
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171
37
14
25
22
1.93
94720273--94720440
46
3.7
46
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1
221
40
14
24
20
1.90
94721361--94721406
21
2.2
21
96
0
83
26
28
21
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94732343--94732387
23
2.0
23
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0
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35
2
13
48
1.54
94739138--94739172
17
2.1
16
89
5
52
74
2
20
2
1.08
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23
2.0
23
100
0
94
25
8
29
36
1.86
94761001--94761054
22
2.6
20
82
8
63
44
18
18
18
1.87
94761018--94761082
22
3.0
22
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44
16
20
18
1.87
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2.3
24
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1.97
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5
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0
0
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2.1
28
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1.88
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2.5
40
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30
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26
1.96
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2.0
22
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9
52
25
2
13
58
1.48
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272
2.0
270
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28
4
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1.57
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22
2.5
22
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54
0
0
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1.00
94788474--94788529
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2.5
22
80
8
60
55
0
0
44
0.99
94791051--94791177
19
6.4
18
72
16
83
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3
0
33
1.17
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10
10.2
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21
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2
0
29
1.13
94791119--94791162
23
2.0
22
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4
0
27
1.09
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1.9
40
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10
104
67
3
0
28
1.07
94791101--94791194
19
4.7
19
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3
1
27
1.12
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9
22.0
9
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1.33
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7.0
8
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25
1
3
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1.13
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18
2.2
19
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9
64
25
0
5
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1.09
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29
2.3
29
75
0
69
40
0
6
53
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94795240--94795300
23
2.7
23
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5
61
62
1
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27
1.33
94799808--94799914
45
2.4
45
87
0
160
41
17
18
22
1.91
94799892--94799921
12
2.5
12
94
0
51
43
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23
16
1.87
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2.8
13
100
0
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61
0
0
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1
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2.2
28
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5
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2.5
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2
3
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1.27
94802475--94802574
23
4.6
21
79
16
80
62
3
2
33
1.22

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362