Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  17  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5267951--5268008
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5279380--5279706
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112
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100
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0
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2.0
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2.0
22
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119
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0
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16
19
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5359897--5360164
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83
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19
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5361802--5361885
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2.4
35
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18
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2
3
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1.25
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20
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0
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0
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5369235--5369346
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24
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4.2
26
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202
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0
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40
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0
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2
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0
337
21
5
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20
2.2
21
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62
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63
2
1
32
1.17
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7
152
36
24
24
15
1.93
5377287--5377398
54
2.1
54
91
3
181
36
24
24
15
1.93
5379016--5379151
26
5.2
26
97
0
245
36
23
5
34
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5380216--5380306
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4.9
19
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15
9
37
1.81
5380216--5380306
35
2.5
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132
37
15
9
37
1.81
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3.8
207
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22
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1
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0
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8
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15
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5
8
0
86
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0
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22
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5
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24
1.97
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166
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19
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2.4
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11
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29
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1
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1.27
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5
0
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160
36
22
23
17
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5450703--5451326
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113
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20
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27
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22
72
37
22
20
20
1.95
5461145--5461190
23
2.0
23
91
0
74
41
19
19
19
1.91
5461380--5461474
28
3.6
24
81
13
93
46
33
4
15
1.66
5461394--5461477
28
3.0
28
91
1
132
46
30
3
19
1.66
5465597--5465704
26
4.2
26
92
0
180
32
7
25
35
1.84
5467302--5467438
27
5.1
27
83
11
183
18
25
21
34
1.96
5467299--5467438
54
2.6
54
95
2
246
17
25
22
34
1.96
5467302--5467460
81
2.0
80
84
8
207
19
25
21
33
1.97
5469014--5469057
19
2.3
19
84
7
54
22
0
6
70
1.11
5469265--5469347
11
7.5
11
68
20
57
31
2
9
56
1.44
5469395--5469457
3
20.3
3
78
12
65
28
6
1
63
1.28
5473090--5473122
17
2.0
17
88
5
50
72
6
15
6
1.24
5473834--5473872
13
3.0
13
80
0
51
30
0
0
69
0.89
5473904--5473950
3
15.0
3
82
8
58
31
4
0
63
1.13
5473904--5473948
13
3.5
13
87
3
65
31
4
0
64
1.13
5473904--5473950
16
2.9
16
77
20
53
31
4
0
63
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5474180--5474239
3
20.7
3
79
3
61
25
3
5
66
1.27
5476120--5476227
26
4.2
26
92
0
180
32
6
24
37
1.81
5482053--5482101
3
16.3
3
100
0
98
67
0
0
32
0.91
5482719--5483015
3
98.7
3
77
7
273
30
6
1
61
1.30
5483082--5483120
18
2.2
18
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0
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15
5
2
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1.06
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15
3.0
15
90
6
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33
24
6
35
1.82
5487755--5487924
46
3.7
46
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10
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30
29
19
20
1.97
5487762--5487934
93
1.9
93
88
0
265
30
29
19
20
1.97
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19
2.0
20
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5
69
0
18
5
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3.3
142
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3
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30
19
22
27
1.98
5508540--5508585
3
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3
100
0
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32
0
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3
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3
173
30
5
1
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1.30
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2.5
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170
30
6
1
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1.30
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28
2.1
31
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13
80
57
0
0
42
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144
2.0
147
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2
438
46
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14
29
1.76
5519089--5519153
20
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18
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17
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33
1
0
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1.03
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28
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1
0
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10
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10
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58
33
2
0
64
1.06
5527998--5528072
23
3.3
23
75
14
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36
1
0
62
1.04
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23
2.1
23
84
8
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36
2
0
60
1.09
5528493--5528549
17
3.3
17
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13
53
31
1
3
63
1.22
5532018--5532162
75
2.0
73
95
2
263
39
13
22
25
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5533172--5533198
13
2.1
13
100
0
54
62
0
7
29
1.22
5533719--5533815
3
32.7
3
74
13
58
57
1
7
34
1.33
5534758--5534829
31
2.3
31
95
0
126
15
19
47
18
1.83
5535220--5536134
43
20.9
43
67
10
287
22
20
20
36
1.96
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3.4
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89
2
432
20
20
21
38
1.94
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2.4
86
87
3
299
21
20
21
37
1.95
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309
3.1
309
94
0
1647
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21
20
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394
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1017
23
21
20
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2.4
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88
0
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21
20
21
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1.95
5540945--5541007
18
3.5
18
95
0
108
11
42
17
28
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362