Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  212  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71635800--71635837
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220
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25
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2.1
289
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26
1.97
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335
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25
1.97
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3.5
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0
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25
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1.8
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139
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33
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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21
1.99
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28
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32
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28
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1.99
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23
20
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2.6
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0
206
29
28
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1.98
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29
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20
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1.9
13
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0
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4
32
40
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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22
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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4
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12
100
0
54
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0
7
7
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19
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1.8
93
91
0
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29
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23
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30
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18
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57
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1
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42
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42
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8
170
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18
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1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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1.83
71894414--71894555
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2.3
63
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1.96
71916394--71916572
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1.96
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0
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2
0
45
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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100
0
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132
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0
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17
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133
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20
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23
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2.1
37
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0
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28
30
19
21
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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