Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  56  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16792812--16792907
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100
0
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8
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52
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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16867132--16867200
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28
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26
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22
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19
1.94
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378
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22
20
18
1.94
16901293--16901603
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20
17
1.92
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0
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32
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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2.7
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154
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4
70
1.21
16908314--16908369
19
3.3
19
63
31
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19
3
7
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5.2
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53
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20
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13
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59
54
15
0
30
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16977921--16977972
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26
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26
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0
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16
121
25
17
24
32
1.97
17054040--17054160
43
2.8
43
86
5
147
33
26
14
24
1.94
17056137--17056166
6
5.0
6
95
0
51
3
16
46
33
1.64
17059673--17059758
40
2.2
39
89
2
127
30
29
16
24
1.96
17063706--17063830
45
2.6
48
85
7
157
27
28
16
27
1.97
17071576--17071780
27
7.6
27
86
3
259
26
15
27
30
1.96
17071577--17071780
109
1.9
108
89
3
320
26
15
27
30
1.96
17079856--17079910
22
2.4
24
82
8
71
1
45
1
50
1.22
17080568--17080606
12
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10
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0
28
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1.12
17081360--17081404
18
2.5
19
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4
28
0
66
1.11
17081519--17081547
13
2.1
14
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6
51
0
41
0
58
0.98
17081640--17081685
17
2.8
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2
36
0
60
1.09
17081692--17081737
19
2.4
18
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13
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0
41
2
56
1.11
17083375--17083579
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27
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26
15
27
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1.96
17088878--17088977
28
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28
77
0
92
26
27
17
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1.97
17088989--17089071
40
2.1
39
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2
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30
28
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1.95
17094329--17094362
13
2.6
13
100
0
68
14
14
50
20
1.78
17098211--17098259
9
5.4
9
80
9
64
36
0
0
63
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17101580--17101628
20
2.5
19
80
6
62
38
2
8
51
1.43
17101745--17101787
19
2.3
19
79
0
50
34
11
13
39
1.82
17101753--17101789
19
1.9
19
88
0
56
32
8
18
40
1.80
17107630--17107667
19
2.0
20
85
15
53
39
23
0
36
1.55
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1.8
93
92
0
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28
28
21
22
1.99
17107892--17108064
46
3.7
46
79
10
199
29
27
20
22
1.99
17108486--17108546
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2.0
30
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3
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32
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4
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1.77
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7
4.9
7
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0
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25
20
1.95
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1.9
50
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8
124
37
15
26
20
1.93
17125107--17125211
50
2.1
50
80
7
115
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16
24
20
1.93
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2.4
41
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0
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28
23
20
1.99
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2.8
110
85
8
390
60
15
0
23
1.38
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109
2.6
111
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4
428
60
15
0
24
1.38
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3.0
109
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310
60
14
0
24
1.36
17137237--17137387
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2.1
71
93
0
257
30
29
17
23
1.97
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104
2.2
104
92
2
369
31
31
19
17
1.95
17137237--17137424
71
2.6
71
88
5
243
30
30
17
20
1.96
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30
2.2
29
81
10
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29
28
6
35
1.82
17137865--17137921
30
1.9
30
85
3
80
29
24
7
38
1.82
17143669--17143728
13
4.6
13
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0
23
1
75
0.90
17147677--17147794
46
2.6
45
88
5
168
25
27
19
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17147677--17147836
46
3.5
46
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6
148
25
29
18
26
1.98
17175251--17175508
46
5.5
47
76
8
192
24
29
17
28
1.97
17175339--17175511
94
1.9
92
85
7
242
23
29
18
28
1.98
17175251--17175508
140
1.8
140
84
3
349
24
29
17
28
1.97
17182918--17183182
47
5.7
46
77
11
222
24
29
18
28
1.98
17182918--17183182
94
2.8
93
84
7
279
24
29
18
28
1.98
17182922--17183179
46
5.5
46
78
7
220
24
29
17
29
1.97
17182922--17183179
140
1.8
140
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371
24
29
17
29
1.97
17183385--17183458
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2.0
37
97
0
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17
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4.0
8
100
0
64
50
25
25
0
1.50

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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