Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  71  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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G
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0
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34
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
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Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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22
20
20
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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37
1.93
22280163--22280421
81
3.2
80
79
7
231
26
14
20
38
1.90
22283110--22283152
18
2.4
18
84
7
52
32
16
32
18
1.93
22303329--22303506
27
6.6
27
83
3
205
26
15
28
29
1.96
22303330--22303485
82
1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96
22303326--22303506
82
2.2
81
83
2
229
27
15
27
29
1.96
22311403--22311580
27
6.6
27
83
3
205
26
15
28
29
1.96
22311404--22311559
82
1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96
22311400--22311580
82
2.2
81
83
2
229
27
15
27
29
1.96
22323655--22323694
6
6.7
6
94
0
71
55
0
27
17
1.43
22325530--22325698
71
2.4
71
80
4
180
27
15
20
36
1.93
22327267--22327414
24
5.8
24
81
12
170
39
14
22
23
1.91
22327256--22327430
52
3.4
52
91
1
271
37
14
23
24
1.93
22327454--22327652
51
3.9
51
89
0
299
33
14
23
28
1.94
22345868--22345910
21
2.0
23
86
9
63
51
4
6
37
1.50
22348607--22348650
15
3.0
15
83
6
63
38
0
9
52
1.33
22349361--22349494
67
2.0
67
84
4
175
52
11
5
29
1.61
22349977--22350029
15
3.4
16
80
19
67
66
1
0
32
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22349977--22350048
31
2.4
31
86
6
94
69
2
0
27
1.02
22349983--22350049
32
2.2
31
82
12
84
70
2
0
26
1.02
22350081--22350129
25
2.0
25
91
0
80
65
2
0
32
1.04
22351700--22352382
90
7.6
90
90
0
1035
26
27
14
30
1.95
22351783--22352414
45
14.1
44
66
14
283
26
27
14
30
1.95
22363810--22363937
67
2.0
67
85
4
181
52
12
5
29
1.61
22364009--22364042
18
1.9
18
88
5
52
73
2
2
20
1.09
22364421--22364490
12
6.0
12
78
9
65
70
2
0
27
1.02
22364416--22364471
21
2.8
20
80
20
71
64
3
0
32
1.11
22364411--22364486
33
2.3
33
84
6
102
68
3
0
27
1.07
22364522--22364575
12
4.4
13
73
17
53
68
1
0
29
1.00
22364522--22364575
24
2.2
25
90
3
83
68
1
0
29
1.00
22364528--22364575
11
4.1
11
79
12
51
68
2
0
29
1.01
22364776--22364920
72
2.0
72
100
0
290
52
4
15
28
1.61
22366966--22367005
20
2.0
20
100
0
80
40
35
5
20
1.74
22374266--22374300
17
2.1
17
89
10
54
42
0
34
22
1.54
22374364--22374512
69
2.2
69
85
4
194
20
14
28
36
1.92
22382765--22382946
40
4.6
40
87
4
244
31
26
20
20
1.98
22382774--22382946
79
2.2
78
85
4
231
31
26
20
21
1.98
22387537--22387600
31
2.0
32
82
11
78
53
1
0
45
1.10
22387585--22387615
14
2.1
15
94
5
55
54
0
3
41
1.16
22389606--22389639
17
1.9
18
88
5
52
70
8
0
20
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22389600--22389659
24
2.6
22
82
10
59
73
6
3
16
1.18
22398645--22398678
17
2.0
17
88
11
52
70
2
0
26
1.01
22409213--22409369
43
3.7
43
74
9
124
25
16
23
34
1.95
22414085--22414222
55
2.5
55
79
0
159
28
30
25
15
1.96
22419735--22419768
13
2.6
13
100
0
68
17
14
20
47
1.83
22433448--22433551
42
2.5
42
81
4
104
23
23
34
19
1.96
22439956--22440042
43
2.0
43
97
0
165
49
5
24
20
1.70
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61
1.9
61
94
0
207
50
13
23
12
1.76
22444318--22444440
49
2.5
49
81
4
140
21
24
21
31
1.98
22444460--22444674
46
4.6
47
78
6
222
23
29
17
28
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362