Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  1  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6878--6937
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30
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0
111
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11
10
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1.74
13573--13650
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2.9
27
96
0
138
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29148--29184
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0
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16
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35736--35773
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20
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10
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18
2
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59106--59146
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2.0
21
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0
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21
29
19
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2
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2.1
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100803--100838
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0
0
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4.3
6
100
0
52
15
0
0
84
0.62
117061--117101
2
21.0
2
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5
57
51
2
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1.14
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2.0
28
82
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3
1
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122674--122706
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2.3
15
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5
50
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1.18
129971--130002
6
5.3
6
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0
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18
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0
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4
30
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2
0
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1
1
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2.5
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12
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0
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0
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29
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3
27.3
3
77
7
85
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2
3
61
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
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3
35
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167070--167153
31
2.9
27
77
15
78
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2
4
40
1.35
167752--167818
31
2.2
31
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0
80
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10
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167762--167820
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1.9
31
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0
100
40
5
10
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17
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0
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6
53
26
6
0
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192938--192982
23
2.0
23
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33
2
0
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15
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1.9
33
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0
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247
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2
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12
18
38
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13
5.2
13
70
15
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1
0
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2.0
39
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2
1
53
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34
2.0
34
94
0
118
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4
35
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21
2.2
20
89
10
76
61
0
10
27
1.29
243468--243561
27
3.5
27
84
8
111
34
20
25
20
1.96
243486--243569
27
3.1
26
86
6
114
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25
17
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26
4.2
26
91
0
180
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6
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1.81
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17
2.5
17
100
0
86
13
39
25
20
1.90
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17
11.4
17
71
20
130
32
48
0
18
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1.9
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93
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100
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48
0
15
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252011--252104
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2.0
47
87
0
134
35
45
0
19
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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37
46
0
16
1.47
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30
2.8
30
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0
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35
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0
15
1.45
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2.0
101
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0
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48
0
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1.55
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24
1.9
24
95
0
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26
50
2
21
1.60
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101
2.3
101
94
0
384
32
48
0
18
1.55
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2.0
30
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3
82
24
10
0
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26
4.0
26
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0
181
32
7
24
35
1.84
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26
2.0
26
82
7
63
37
20
15
26
1.92
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219
29
16
29
24
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28
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56
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235
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15
27
26
1.96
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28
3.7
29
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8
108
28
21
27
23
1.99
258949--259127
56
3.2
55
82
4
218
29
16
27
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2.1
15
100
0
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6
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10
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12
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18
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1.95
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36
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6
14
0
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23
2.1
23
88
7
71
10
12
0
76
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
331578--331611
17
2.0
17
94
0
59
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23
17
14
1.86
334508--334599
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3.0
31
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3
105
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2
46
1.41
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5
100
0
50
60
0
0
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27
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11
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15
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2.0
22
95
0
81
44
22
15
17
1.86
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2.0
21
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0
64
19
29
21
29
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57
0
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1
0
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15
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10
50
54
0
0
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0.99
358344--358391
22
2.1
24
84
7
64
43
2
0
54
1.12
359311--359442
27
4.9
27
81
10
146
34
21
24
18
1.96
359337--359445
54
2.0
53
94
1
191
34
22
24
17
1.96
361529--361580
19
2.7
19
85
8
61
40
7
0
51
1.30
361543--361594
20
2.6
19
82
11
59
38
3
1
55
1.29
364982--365045
2
32.0
2
100
0
128
50
0
0
50
1.00
377046--377086
23
1.9
21
85
14
57
0
43
0
56
0.99
380020--380070
22
2.3
22
86
10
68
56
0
3
39
1.18
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26
2.2
25
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6
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37
3
5
53
1.42
383705--383756
26
2.0
26
96
0
95
40
0
5
53
1.25
386804--386836
17
1.9
17
100
0
66
33
12
12
42
1.79
392585--392609
3
8.3
3
100
0
50
36
0
64
0
0.94
395011--395087
40
1.9
40
100
0
154
27
25
12
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
412321--412376
27
2.0
28
93
3
96
30
12
10
46
1.76
413084--413121
18
2.1
18
100
0
76
47
21
0
31
1.51
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7
3.6
7
100
0
50
32
0
0
68
0.90
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10
2.5
10
100
0
50
32
8
40
20
1.81
428687--428727
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
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44
13.6
45
77
5
549
29
26
16
26
1.97
436388--436978
132
4.5
132
94
0
1013
29
26
16
26
1.97
436388--436978
263
2.2
263
92
0
984
29
26
16
26
1.97
436973--437309
45
7.4
47
64
16
156
29
24
19
27
1.98
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3.2
136
94
1
724
29
23
20
26
1.99
436962--437278
46
7.0
46
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14
165
29
24
19
26
1.98
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19
2.3
20
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7
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40
11
20
27
1.86
445180--445220
20
2.0
20
100
0
82
43
9
4
41
1.59
451828--451877
17
2.7
20
78
18
70
10
0
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1.37
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17
2.7
20
78
18
70
10
0
44
46
1.37
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12
2.3
12
100
0
56
0
0
7
92
0.37
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30
3.6
29
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16
74
25
1
9
62
1.36
469162--469198
17
2.2
17
90
0
56
62
10
0
27
1.28
474288--474428
52
2.7
52
85
5
169
29
17
24
28
1.97
475271--475308
20
1.9
20
94
0
67
18
36
34
10
1.85
477540--477598
3
19.7
3
78
0
55
54
1
37
6
1.37
477540--477595
21
2.7
21
82
0
67
53
1
37
7
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
481275--481330
28
2.0
28
100
0
112
35
21
17
25
1.95
486238--486280
19
2.2
20
87
4
61
25
4
2
67
1.22
486237--486290
20
2.7
21
77
13
60
29
3
1
64
1.21
486461--486507
22
2.2
22
88
7
71
31
0
0
68
0.90
501225--501256
16
2.0
16
100
0
64
12
12
25
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1.75
502147--502188
16
2.5
16
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18
50
35
0
7
57
1.26
503975--504023
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2.1
24
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11
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28
8
0
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1.23
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2.0
29
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37
13
10
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2.0
17
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0
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2
0
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1.11
521453--521523
31
2.3
31
92
0
124
38
15
19
26
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362