Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  9  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3006718--3007037
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1.9
100
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2.4
24
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2.0
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0
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21
25
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2.2
28
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10
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26
20
26
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3080579--3080634
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2.5
22
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42
17
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1.80
3081336--3081380
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2.4
18
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0
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0
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7
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63
0
0
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0.95
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13
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0
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0
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18
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4.6
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2.0
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2.1
30
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0
0
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2.0
22
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56
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2.3
20
85
11
58
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11
2
77
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
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2
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2.0
17
88
5
50
33
3
9
54
1.47
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0
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0
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2.7
29
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93
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0
56
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3243962--3243998
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0
0
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18
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23
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2.2
81
81
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199
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56
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31
6
5
56
1.46
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23
8.8
25
68
19
68
31
6
4
57
1.44
3256885--3256919
13
2.6
14
82
17
56
80
0
20
0
0.72
3257929--3257964
14
2.7
13
87
8
54
16
11
5
66
1.40
3257928--3257972
13
3.4
13
84
6
63
15
8
6
68
1.36
3257864--3258236
99
3.9
99
82
8
380
26
16
18
38
1.92
3258142--3258982
148
5.6
148
83
7
1012
30
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1.93
3258142--3258827
75
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75
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30
15
19
34
1.93
3258823--3258990
77
2.2
77
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2
205
27
18
17
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1.94
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18
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1.93
3258919--3259225
91
3.4
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1.92
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87
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29
15
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1.92
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18
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18
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28
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50
7
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1.72
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30
4.3
30
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0
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1.73
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34
6
3
55
1.43
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25
8.6
25
72
13
100
32
6
4
56
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3260556--3260724
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2.2
79
80
6
193
32
6
4
56
1.46
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25
2.3
24
79
14
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37
16
3
42
1.65
3262668--3262702
4
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4
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0
70
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0
25
48
1.51
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21
2.2
22
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3
78
21
19
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50
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193
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193
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1
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14
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1.83
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12
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0
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0
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21
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2
4
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33
1.86
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24
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0
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1.85
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0
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0
0
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0
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27
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0
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0
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22
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0
0
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1.81
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12
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0
0
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0
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0
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28
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8
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50
2
1
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1.24
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18
2.0
18
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14
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35
2
0
61
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3313884--3313929
19
2.5
19
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3
58
39
2
0
58
1.10
3313771--3313959
90
2.0
90
79
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197
50
3
3
43
1.34
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14
1.9
14
100
0
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51
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29
1.64
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2.5
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22
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16
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0
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9
0
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2
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147
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1.94
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2.4
22
93
0
88
15
24
32
28
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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