Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  37  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10864105--10864133
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14
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0
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2.0
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1.63
10869815--10869843
13
2.1
14
93
6
51
20
3
0
75
0.94
10877301--10877338
9
4.3
9
81
18
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0
0
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0.83
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0
0
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214
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0
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1
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10897386--10897703
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6.3
52
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426
28
22
13
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1.93
10897343--10897709
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98
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1.8
196
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0
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2.1
19
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53
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2.0
24
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20
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2.4
25
83
8
70
40
16
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21
1.92
10917035--10917082
25
2.0
25
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80
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20
22
18
1.94
10917094--10917176
25
3.4
24
77
8
87
34
19
25
20
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10917110--10917174
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2.7
23
80
4
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33
20
26
20
1.96
10917167--10917226
26
2.3
27
82
5
79
43
23
16
16
1.87
10921298--10921471
45
3.9
45
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201
35
16
22
25
1.95
10921359--10921513
45
3.5
44
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5
168
34
18
22
24
1.96
10921437--10921555
45
2.7
44
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5
132
43
17
21
17
1.88
10923519--10923611
42
2.2
42
90
0
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18
22
26
32
1.97
10928833--10929142
46
6.7
46
87
1
415
42
14
23
19
1.88
10928826--10929142
93
3.4
93
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1
485
42
15
23
19
1.88
10930957--10931112
52
3.0
52
78
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181
25
17
26
30
1.97
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115
2.0
115
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2.0
41
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43
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17
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23
2.0
23
100
0
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21
1.71
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1
38
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2.1
35
100
0
144
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13
2
37
1.59
10967564--10967607
23
2.0
22
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4
70
15
11
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63
1.51
10968163--10968197
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2.4
14
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52
17
5
2
74
1.14
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2.0
21
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38
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12
71
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20
2.0
20
85
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55
37
2
2
57
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2.0
19
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0
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0
0
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1.00
10993807--10993847
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2.2
19
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4
57
51
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10995934--10995963
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30
16
1.96
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5.7
6
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20
58
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2.2
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32
17
28
21
1.96
11023565--11023748
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2.8
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185
29
17
29
23
1.97
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2.2
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84
31
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1.90
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18
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26
50
1.65
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1.9
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17
20
1.95
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2.1
22
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24
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1.69
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5
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27
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15
23
1.69
11047556--11047726
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204
47
11
16
23
1.79
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24
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10
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1.44
11050542--11050720
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3.7
47
78
10
175
24
30
20
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11050541--11050719
49
3.7
47
75
14
170
24
30
20
25
1.98
11050735--11050862
46
2.7
47
81
4
134
22
29
17
30
1.96
11053067--11053332
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5.7
46
74
10
184
22
28
19
28
1.98
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238
23
27
19
29
1.98
11053067--11053330
140
1.9
140
82
7
329
23
28
19
28
1.98
11062508--11062554
20
2.3
20
85
14
69
48
6
0
44
1.28
11062496--11062554
21
2.9
20
85
9
75
47
5
0
47
1.24
11068275--11068731
48
9.7
48
74
5
299
26
19
28
24
1.99
11068275--11068731
144
3.2
142
84
5
552
26
19
28
24
1.99
11070063--11070121
30
2.0
30
83
6
75
38
0
40
20
1.53
11070336--11070372
9
4.1
9
92
0
65
29
10
13
45
1.77
11072863--11072907
22
2.0
22
100
0
90
26
15
22
35
1.94
11077577--11077625
11
4.4
11
77
12
55
40
20
0
38
1.53
11078605--11078639
16
2.2
16
89
0
52
45
0
0
54
0.99
11080055--11080093
19
2.2
18
86
9
53
46
5
12
35
1.65
11097222--11097281
17
3.5
17
71
13
59
50
40
0
10
1.36
11103748--11103776
8
3.6
8
100
0
58
10
24
24
41
1.86
11104962--11105069
26
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26
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0
180
37
24
6
32
1.81
11106109--11106160
13
4.2
12
79
20
54
21
0
1
76
0.87
11106107--11106162
23
2.4
24
88
8
89
23
0
1
75
0.90
11120667--11121067
201
2.0
201
90
2
637
31
21
21
24
1.98
11121500--11121544
20
2.2
20
96
0
81
44
0
15
40
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11124906--11124946
21
2.1
18
86
13
55
34
14
7
43
1.73
11129285--11129349
23
3.0
22
78
13
80
38
24
21
15
1.92
11129708--11129745
13
2.8
13
85
14
51
28
10
0
60
1.30
11131171--11131224
5
11.0
5
80
4
65
55
3
0
40
1.17
11132235--11132275
6
6.8
6
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10
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21
17
29
31
1.96
11135362--11135405
20
2.3
19
84
4
52
27
15
29
27
1.96
11136249--11136303
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2.0
27
96
0
101
23
16
0
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1.36
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28
1.9
27
84
3
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60
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7
24
1.50
11149776--11149822
20
2.4
19
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8
0
55
1.31
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32
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1
150
36
20
12
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1.90
11158937--11159265
163
2.0
161
93
1
559
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14
18
30
1.91
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483
2.0
483
92
0
1620
24
24
15
36
1.94
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3.3
847
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3278
26
23
14
34
1.94
11169502--11171633
885
2.4
884
84
3
2784
26
24
15
34
1.94
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42
2.2
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15
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34
4
10
50
1.58
11180906--11180945
19
2.2
18
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40
2
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1.60
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1.9
30
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0
105
24
0
7
68
1.14
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2.5
23
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61
7
0
31
1.24
11189935--11189980
15
2.9
15
90
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65
67
0
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26
1.15
11189902--11189968
21
3.0
23
76
21
72
64
0
5
29
1.17
11189929--11190012
44
1.9
44
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13
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0
7
26
1.17
11189927--11190012
15
5.9
14
75
14
59
66
0
6
26
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11191275--11191366
32
2.8
32
80
5
94
54
10
10
23
1.67
11192929--11192969
18
2.2
19
87
12
59
29
24
0
46
1.53
11193495--11193566
24
2.9
26
77
10
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13
0
37
1.43
11194403--11194436
12
2.8
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52
52
5
0
41
1.25
11195036--11195073
15
2.5
15
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8
51
44
2
2
50
1.30
11196647--11196899
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213
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26
16
28
1.97
11196649--11196900
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3.0
86
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1
285
29
26
15
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1.96
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0
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0
0
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0
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1.84
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46
9.0
46
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1
529
40
14
22
21
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362