Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  180  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59405093--59405364
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25
1.99
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22
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21
28
1.99
59417185--59417612
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4.4
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410
24
27
20
27
1.99
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1.99
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1.9
191
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3
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26
27
19
26
1.99
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2.7
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2.6
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26
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20
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1.99
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4.8
48
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27
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18
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8
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1.99
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5.6
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3
191
25
21
28
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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80
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1.99
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49
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22
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21
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1.99
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4.6
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1.98
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1.49
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23
26
26
2.00
59515034--59515253
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23
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168
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15
29
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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1.9
103
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29
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1.98
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1.9
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18
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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0
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19
3
38
1.71
59637426--59637463
19
2.0
19
100
0
76
47
15
15
21
1.82
59643123--59643198
24
3.2
24
66
7
66
17
2
31
48
1.60
59643124--59643216
46
2.0
46
95
0
168
13
3
31
51
1.57
59643134--59643209
24
3.2
24
66
14
68
13
2
30
53
1.53
59647993--59648019
10
2.7
10
100
0
54
51
14
11
22
1.73
59648384--59648456
36
2.0
36
100
0
146
49
13
8
28
1.71
59653947--59654019
35
2.1
35
97
0
137
41
17
5
35
1.73
59657573--59657635
29
2.1
30
85
8
85
60
0
0
39
0.97
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27
2.3
28
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60
0
1
38
1.07
59657588--59657660
28
2.7
27
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10
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61
0
1
36
1.05
59657602--59657664
18
3.5
18
78
6
74
58
0
1
39
1.07
59659998--59660091
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2.5
37
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111
28
7
21
42
1.80
59665078--59665130
23
2.4
22
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9
18
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1.25
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0
0
20
0.72
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21
2.3
21
100
0
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20
37
29
12
1.90
59679182--59679338
43
3.7
42
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13
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17
23
1.97
59683425--59683484
30
2.0
30
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0
84
40
6
25
28
1.80
59685770--59685813
14
2.7
18
73
26
60
45
4
18
31
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.7
31
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1
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29
22
15
32
1.95
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26
5.3
26
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5
174
27
23
21
27
1.99
59688256--59688393
53
2.7
52
90
6
212
27
23
21
28
1.99
59689194--59689285
27
3.4
27
85
8
116
19
26
19
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1.96
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1.81
59689430--59689581
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1.9
80
84
0
205
28
7
21
42
1.81
59689430--59689581
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2.8
53
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2
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28
7
21
42
1.81
59689402--59689595
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169
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8
22
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1.83
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27
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120
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20
37
1.84
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2.4
54
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0
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34
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43
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1.97
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3.7
46
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21
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1.99
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1.8
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93
0
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1.99
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35
0
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40
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22
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2.0
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20
21
29
28
1.98
59744561--59744732
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
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21
21
29
27
1.98
59754144--59755824
561
3.0
556
87
3
2345
32
16
15
35
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59757116--59757147
16
2.0
16
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0
55
40
0
0
59
0.97
59757140--59757245
51
2.1
51
98
0
203
31
17
9
41
1.82
59759927--59759984
28
2.0
30
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10
12
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2.1
16
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0
50
50
14
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2.0
21
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21
29
19
1.98
59767205--59767238
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2.1
16
88
0
50
50
14
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17
1.79
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3.2
21
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1.91
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135
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20
28
22
1.99
59797702--59797821
46
2.6
44
81
7
134
26
18
30
25
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362