Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  1  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4285--4338
16
3.4
16
79
5
74
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22
25
24
2.00
4457--4551
41
2.3
41
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120
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4649--4861
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117
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2
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23
1.68
9500--9562
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2.0
31
100
0
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57
3
33
6
1.40
11845--11927
39
2.1
39
90
0
130
20
18
39
21
1.92
14977--15008
16
2.0
16
100
0
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25
25
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18301--18358
21
2.8
21
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12
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15
10
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25183--25444
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2.0
132
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0
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24
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100
0
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0
30
0
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2.8
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8
13
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36360--36418
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2.4
25
81
10
68
66
5
0
28
1.13
36400--36443
19
2.2
20
80
4
54
77
4
2
15
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49
5.9
49
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30
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107
3.0
98
89
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465
33
8
27
30
1.86
39193--39381
96
1.9
97
93
2
326
34
8
27
29
1.86
39468--39558
37
2.4
37
96
1
164
23
18
32
25
1.97
48697--48727
15
2.1
15
100
0
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48
6
6
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3.0
35
94
0
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18
30
27
23
1.97
51402--51458
19
3.2
19
67
23
59
17
29
28
24
1.97
51375--51477
35
3.0
34
87
5
102
19
28
30
22
1.98
54679--54764
42
2.0
42
95
0
154
43
12
16
27
1.84
61579--61693
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61579--61712
46
3.0
45
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4
153
35
14
23
26
1.93
66562--66727
35
4.6
35
84
8
192
33
24
10
31
1.90
66557--66727
74
2.4
73
83
9
217
33
23
11
31
1.90
68710--68824
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
68710--68843
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
86664--86698
17
2.1
17
88
0
52
17
5
28
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105695--105719
12
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12
100
0
50
36
0
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1.29
113414--113442
2
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2
100
0
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0
0
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119004--119044
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2.0
21
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0
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29
21
29
19
1.98
122493--122541
22
2.2
22
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13
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40
1.10
127217--127326
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3.1
36
100
0
220
30
16
16
37
1.91
130032--130098
34
2.0
34
100
0
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11
14
46
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130386--130424
2
19.5
2
100
0
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51
0
0
48
1.00
138366--138455
44
2.0
44
97
0
171
38
14
11
35
1.82
150076--150129
23
2.4
23
73
14
58
57
3
11
27
1.50
155027--155068
10
4.1
10
79
14
50
47
0
2
50
1.14
163422--163477
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2.0
28
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0
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1.71
171563--171614
26
2.0
26
100
0
104
46
11
19
23
1.82
173478--173522
15
2.9
15
81
15
56
48
0
0
51
1.00
174925--174978
13
3.8
14
75
20
58
51
11
12
24
1.72
174919--174982
30
2.1
30
100
0
128
48
9
14
28
1.74
175366--175487
63
2.0
62
85
8
167
41
21
8
28
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
178609--178643
8
4.4
8
100
0
70
25
14
37
22
1.92
197762--197825
31
2.1
31
90
0
101
35
9
9
45
1.69
199887--199924
16
2.3
17
86
4
51
31
2
5
60
1.33
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22
2.0
22
86
0
61
50
0
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38
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0
0
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10
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58
0
0
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2.5
22
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8
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48
1
0
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16
1.9
16
100
0
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45
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25
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1.76
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2.2
18
90
0
62
55
10
7
27
1.60
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1.9
18
94
0
61
40
48
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8
1.49
215213--215239
13
2.1
13
100
0
54
40
44
0
14
1.46
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2.1
28
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0
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0
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1.8
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480
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20
12
23
1.85
217841--218257
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2.8
147
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4
563
41
23
12
23
1.87
218300--218844
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3.3
162
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7
590
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24
11
19
1.83
218300--218806
173
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172
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5
534
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11
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1.83
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13
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1.20
234143--234324
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4.0
46
90
1
258
21
23
14
40
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
242263--242313
25
2.1
25
82
10
61
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0
1
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1.08
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2.4
190
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16
13
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18
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0
0
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2
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100
0
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8
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0
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0
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2
110
36
5
18
40
1.74
279068--279152
42
2.0
42
100
0
170
32
11
4
50
1.60
281123--281222
50
2.0
50
98
0
191
28
9
14
49
1.73
283982--284096
60
1.9
60
83
3
151
39
8
13
39
1.75
284724--284793
29
2.3
30
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9
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57
10
8
24
1.59
288042--288083
18
2.3
18
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0
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9
11
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1.68
292666--292692
12
2.2
12
100
0
54
29
0
7
62
1.22
292653--292694
12
3.8
11
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9
50
35
0
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1.43
301349--301433
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2.0
42
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0
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31
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302902--302928
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12
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0
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22
0
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1.54
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0
67
1.21
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19
3.1
20
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1
1
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1.15
320052--320113
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1.9
32
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1
0
48
1.10
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33
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32
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9
0
45
1.35
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31
2.8
31
78
13
90
34
5
10
49
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
328377--328631
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1.8
140
84
6
354
43
5
3
47
1.43
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29
2.1
31
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5
85
38
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1
53
1.36
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12
2.5
12
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0
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0
0
43
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28
2.1
28
100
0
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27
20
17
34
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2.1
19
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0
10
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1.36
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58
2.0
58
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0
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25
7
25
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1.82
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0
9
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1.34
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0
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1.34
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69
100
0
280
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18
26
1.70
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0
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0
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0
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2.1
18
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0
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15
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1.70
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2
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0
57
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0
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3
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0
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0
0
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3
0
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2.0
19
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75
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230
31
10
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33
1.89
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20
2.2
20
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0
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2
16.0
2
93
0
55
0
46
0
53
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
379635--379878
39
6.3
39
90
1
375
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28
22
20
1.99
379635--379878
116
2.1
117
91
1
393
28
28
22
20
1.99
379870--379962
39
2.4
39
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0
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26
26
18
27
1.98
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155
1.9
157
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5
414
28
27
21
22
1.99
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155
2.2
155
79
9
393
28
28
21
21
1.99
382041--382119
31
2.7
28
78
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18
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2.0
23
86
9
63
30
2
2
65
1.18

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378