Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  343  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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22
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56
6
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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88
3
265
28
19
25
26
1.99
103716972--103717069
42
2.3
42
91
3
153
30
15
27
26
1.96
103729736--103729802
31
2.3
28
82
12
82
41
14
10
32
1.80
103736901--103736942
20
2.2
20
86
4
59
21
0
7
71
1.09
103736915--103736960
25
1.9
23
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8
65
30
0
6
63
1.20
103737002--103737031
15
1.9
15
93
6
51
0
36
56
6
1.26
103737796--103737825
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
103738797--103738916
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103739056--103739200
58
2.5
59
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11
183
50
9
17
22
1.75
103741853--103741946
27
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27
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10
10
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103741850--103741946
30
3.3
29
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8
126
34
45
10
10
1.72
103741850--103741957
57
1.9
56
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148
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11
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1.77
103745580--103745667
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2.1
42
100
0
176
38
18
11
31
1.86
103746602--103746639
12
3.2
12
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3
51
60
0
39
0
0.97
103747705--103747773
31
2.3
30
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9
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11
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1.68
103747915--103747971
29
1.9
30
92
3
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49
10
7
33
1.64
103747919--103747995
31
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11
6
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6
4.7
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100
0
56
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0
0
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1.00
103748249--103748292
23
2.0
21
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6
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1.57
103748292--103748387
47
2.0
49
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4
133
44
4
6
44
1.48
103752485--103752843
46
7.8
46
91
1
495
22
23
14
38
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103754993--103755044
11
4.7
11
76
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63
3
0
32
1.12
103755576--103755621
18
2.4
18
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8
10
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1.23
103755573--103755623
20
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19
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3
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72
7
11
7
1.28
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23
2.3
23
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0
25
0
0.81
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4
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20
1.31
103756449--103756875
152
3.0
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500
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6
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1.55
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554
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103759469--103759529
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2.3
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1.64
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0
0
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100
0
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0
0
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0.40
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20
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1.88
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10
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0
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35
0
11
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1.38
103792162--103792261
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44
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1.95
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178
2.3
178
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1
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30
17
22
29
1.97
103792339--103792542
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4.6
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17
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29
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27
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2.2
133
94
0
515
30
19
22
28
1.98
103792119--103792766
311
2.1
311
93
0
1109
30
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22
28
1.97
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2.0
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102
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19
24
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1.99
103792060--103792956
489
1.8
487
91
1
1449
31
17
22
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103792430--103794375
178
10.9
178
91
0
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19
22
27
1.98
103794389--103794597
88
2.4
88
86
0
276
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20
25
21
1.98
103796201--103796234
10
3.4
10
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0
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0
11
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1.38
103798896--103798954
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1.9
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1
3
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100
0
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0
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2.0
20
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25
0
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103803098--103803167
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0
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8
10.0
8
72
16
51
53
0
2
44
1.14

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378