Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr01 113035596 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  37  of  378  ( 45343 repeats found )
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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9223101--9223318
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20
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1.9
18
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22
37
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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5
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19
19
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9261606--9261703
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2.2
16
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2
52
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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18
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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2.4
73
84
8
226
33
23
11
31
1.90
9330203--9330553
74
4.9
71
79
9
363
28
15
22
33
1.95
9330203--9330505
142
2.1
143
84
5
387
28
16
22
32
1.96
9330662--9330864
56
3.7
54
86
3
262
30
15
18
34
1.93
9330655--9330864
112
1.9
110
87
2
303
30
15
18
35
1.92
9331058--9331164
44
2.5
44
98
1
207
25
23
29
21
1.99
9331595--9331661
26
2.3
30
73
26
79
40
46
2
10
1.53
9331604--9331663
26
2.3
26
97
2
111
40
46
3
10
1.54
9332785--9332863
3
26.0
3
97
2
149
32
0
1
65
1.00
9335247--9335275
14
2.1
14
100
0
58
51
20
6
20
1.70
9336500--9336546
16
2.9
16
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40
2
4
53
1.32
9337717--9337899
3
59.7
3
84
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215
63
1
3
31
1.17
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15
7.1
14
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18
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65
0
8
26
1.22
9338026--9338098
29
2.5
29
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8
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64
0
9
26
1.24
9338027--9338144
43
2.7
42
78
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64
1
8
25
1.31
9342392--9342477
26
3.3
26
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22
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34
18
17
29
1.94
9342376--9342478
51
2.0
51
100
0
206
34
15
17
32
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9348084--9348121
3
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3
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0
58
0
34
0
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7
8.6
7
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0
57
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1
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18
1.60
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14
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14
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0
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0
42
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9348536--9348582
21
2.2
21
100
0
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42
0
42
14
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46
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1
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1.88
9368336--9368637
138
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138
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0
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0
0
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19
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0
0
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2.1
19
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4
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41
0
10
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39
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112
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20
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28
1.99
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19
2.2
19
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12
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46
0
24
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2.0
40
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0
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18
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0
10
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1.20
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19
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0
16
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2.0
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0
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10
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6
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3
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1.9
43
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2
112
24
12
25
37
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9412398--9412555
43
3.7
43
73
10
153
25
14
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9417049--9417136
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2.0
44
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0
158
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21
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20
2.0
20
95
0
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22
32
20
25
1.98
9418333--9418461
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2.7
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136
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2.0
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60
0
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19
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0
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2.2
32
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11
103
38
0
8
52
1.32

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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