Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  137  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.2
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1.99
38992606--38992772
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205
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22
27
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
A
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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A
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(0-2)
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31
2.0
31
100
0
124
32
3
6
58
1.40
39131146--39131310
91
1.9
88
90
8
266
18
32
8
41
1.80
39133346--39133402
21
2.7
19
80
17
60
47
1
1
49
1.22
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2
20.0
2
94
5
71
48
0
0
51
1.00
39134666--39134702
18
2.0
19
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58
51
2
13
32
1.55
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13
2.0
13
100
0
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15
15
15
1.73
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54
2.0
55
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1
215
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4
0
38
1.20
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42
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20
28
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20
2.0
20
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28
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20
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2.1
101
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2
250
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1.95
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2.0
64
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0
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35
13
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1.93
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2.0
15
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25
0
6
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1.14
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19
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10
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216
1.9
216
96
0
770
29
17
22
30
1.96
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25
24
28
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1.99
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4.2
40
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3
225
25
24
28
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1.99
39196101--39196185
9
8.7
9
74
13
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36
3
1
58
1.23
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8
3.2
8
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0
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0
23
53
1.46
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130
3.5
130
78
6
357
33
18
19
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.8
132
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18
30
1.93
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2
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0
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0
0
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0
0
50
1.00
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44
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1
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24
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15
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1.96
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2.0
60
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0
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37
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1.88
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3.8
130
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3
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17
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1.94
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2
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0
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0
0
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1.9
22
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21
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1.9
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165
31
11
13
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1.80
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42
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1.94
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2.0
16
100
0
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1.88
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16
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42
15
12
30
1.83
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134
4.9
135
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1.86
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38
15
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30
1.88
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27
2.7
27
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1.93
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27
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0
126
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17
1.86
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2.0
211
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0
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20
25
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2.0
199
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573
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13
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2
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0
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0
0
50
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1.57
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34
4.5
34
73
7
121
60
9
10
19
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
40
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0
108
56
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2
28
1.48
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43
2.0
43
88
0
125
28
32
21
17
1.96
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2.0
21
100
0
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39
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1.9
80
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22
30
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22
1.99
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23
1.99
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1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
39278786--39278893
40
2.7
38
85
8
128
21
29
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1.99
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1.94
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144
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15
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1.96
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25
2.7
25
84
13
95
30
23
25
20
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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