Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  312  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.60
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Period
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1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
A
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(0-2)
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69
27
35
3
33
1.73
95116384--95116415
16
2.0
16
93
0
55
53
9
6
31
1.58
95122217--95122277
18
3.4
18
65
13
54
45
6
6
40
1.56
95122218--95122293
35
2.2
35
100
0
152
48
7
5
38
1.55
95126492--95126542
24
2.1
24
100
0
102
33
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29
29
1.85
95127127--95127294
28
6.0
28
75
5
142
33
12
17
36
1.87
95127127--95127294
56
3.0
56
80
1
194
33
12
17
36
1.87
95127127--95127294
84
2.0
84
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2
203
33
12
17
36
1.87
95127568--95127617
20
2.5
20
86
0
64
26
20
16
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1.92
95138123--95138417
48
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48
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335
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28
24
1.97
95138112--95138417
144
2.1
143
92
0
495
29
16
28
25
1.97
95143896--95144045
40
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40
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3
149
28
22
26
22
1.99
95143894--95144047
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1.9
80
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0
200
28
22
26
22
1.99
95143938--95144075
40
3.5
40
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7
136
26
24
28
20
1.99
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28
17
29
24
1.98
95150421--95150882
144
3.2
144
93
1
757
28
17
29
24
1.98
95162331--95162358
12
2.3
12
100
0
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28
0
1.56
95164717--95164766
20
2.5
20
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0
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24
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20
36
1.95
95168843--95168890
20
2.4
20
79
6
53
39
12
6
41
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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0
89
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10
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25
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1.8
93
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0
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29
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20
1.98
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46
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46
79
12
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28
29
21
20
1.98
95180681--95180852
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
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46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
95184329--95184405
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3.7
20
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44
1.65
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4.6
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210
29
19
27
22
1.98
95190930--95191144
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29
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27
22
1.98
95191761--95191816
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2.7
21
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1.95
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23
26
2.00
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1.9
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23
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23
26
2.00
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24
23
2.00
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3.8
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155
22
26
24
26
2.00
95203943--95204094
80
1.9
80
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200
22
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2.00
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0
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0
68
0.90
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13
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0
0
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18
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0
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1.87
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2.3
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53
0
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1.13
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0
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67
4
0
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1.11
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1.9
19
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1.91
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20
2.5
20
83
6
57
34
6
28
32
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95259553--95259724
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3.7
46
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4
249
27
19
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22
1.98
95259501--95259724
92
2.4
94
82
7
260
28
18
30
22
1.97
95268347--95268411
21
3.2
21
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27
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16
24
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1.75
95268346--95268424
39
2.0
39
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0
140
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25
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1.66
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1.76
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30
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3.3
29
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18
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4
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1.35
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47
2.6
48
74
12
118
36
5
3
54
1.39

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378