Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  278  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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(0-2)
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Period
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Copy
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Percent
Indels
Score
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26
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25
2.00
Indices
Period
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Copy
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Score
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171
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1.94
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176
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1.94
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4.2
26
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0
171
33
7
22
37
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83900670--83900732
25
2.5
25
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58
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33
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24
1.98
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45
77
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149
24
30
19
24
1.98
83917111--83917149
2
20.0
2
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71
48
0
0
51
1.00
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13
13
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1.43
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11
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11
100
0
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11
0
38
1.39
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1.80
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18
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0
7
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35
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0
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21
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0
0
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20
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2.7
19
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42
0
7
50
1.31
83961460--83961571
47
2.4
47
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1
154
20
19
17
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1.90
83961458--83961571
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23
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43
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25
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7
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29
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1.98
83983317--83983464
40
3.6
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156
27
20
29
22
1.98
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28
2.2
26
79
5
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6
21
30
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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40
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18
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25
1.98
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18
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20
1.94
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23
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20
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19
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19
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1.96
83999946--84000136
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1.96
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38
0
13
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0
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2.0
183
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11
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28
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2.1
21
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0
70
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34
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0
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3.0
21
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0
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43
0
19
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84012360--84012417
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4.1
14
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0
18
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28
2.1
28
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41
37
0
20
1.53
84012455--84012493
14
2.8
14
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1.62
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0
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2.0
29
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7
78
25
7
14
52
1.67

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378