Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  326  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99073839--99073875
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44
2.8
45
82
4
152
34
13
24
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1.93
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10
16
35
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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30
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30
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2.0
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103
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21
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2
35
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.70
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50
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1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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7
5.0
7
100
0
70
28
0
57
14
1.38
99279660--99279717
29
2.0
29
96
0
107
41
13
15
29
1.86
99287335--99287386
16
3.2
16
86
0
77
42
5
23
28
1.77
99287368--99287504
44
3.1
44
85
6
161
32
5
24
37
1.79
99287609--99287701
39
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104
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2
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99291952--99292059
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26
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173
36
23
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33
1.83
99294933--99294981
23
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22
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32
0
8
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1.27
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30
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15
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58
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17
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99300729--99300806
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1.67
99303712--99303889
46
3.8
49
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14
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28
29
20
21
1.98
99303719--99303889
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1.8
92
92
3
290
28
29
21
21
1.98
99312253--99312304
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19
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1.66
99312821--99312881
24
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0
1
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1.10
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1.83
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0
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0
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1.85
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1.9
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0
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19
19
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1.96
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92
2.6
92
89
0
352
33
19
22
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
25
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2.2
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1.84
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19
4.2
19
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9
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35
16
10
37
1.82
99334443--99334515
36
2.0
38
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35
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1.82
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1.96
99345160--99345300
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1.95
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1.96
99345764--99345904
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54
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21
24
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1.96
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23
18
1.95
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22
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28
1.84
99353956--99354021
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26
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0
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132
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20
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2.9
45
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159
26
22
18
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14.0
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15
1
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47
1.57
99363149--99363249
22
4.7
21
77
7
103
15
1
34
47
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99363150--99363249
29
3.4
29
89
4
157
16
2
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1.57
99366458--99366823
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8.0
46
89
0
464
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22
13
42
1.88
99373384--99373613
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2.4
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7
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24
1.97
99373340--99373611
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5.7
48
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167
30
18
26
24
1.97
99380967--99381248
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48
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210
28
19
28
24
1.98
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2.8
96
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1
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29
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1.98
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0
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0
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0
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2.0
22
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9
61
47
4
11
35
1.61

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378