Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  196  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.95
Indices
Period
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Copy
Number
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1.95
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3.1
41
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Copy
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11
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
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A
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(0-2)
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0
47
1.00
57912823--57912865
22
2.0
22
85
0
59
58
4
11
25
1.52
57913129--57913169
21
2.0
20
86
9
57
31
4
2
60
1.30
57915152--57915192
19
2.2
19
86
8
57
60
12
4
21
1.50
57916230--57916263
11
3.1
11
91
0
50
50
0
44
5
1.26
57920350--57920393
20
2.2
20
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18
1.27
57922076--57922121
14
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15
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43
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57922062--57922128
14
4.7
14
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7
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38
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1.67
57922587--57922635
22
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22
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20
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28
1.68
57923626--57923686
32
1.9
32
93
0
104
49
18
4
27
1.68
57923626--57923699
32
2.5
30
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10
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18
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1.65
57926799--57926826
2
14.0
2
100
0
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0
0
50
1.00
57928961--57928986
5
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5
100
0
52
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0
0
61
0.96
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1.9
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1
156
47
6
19
26
1.73
57932336--57932849
131
3.9
130
78
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482
27
20
18
34
1.95
57939684--57939751
28
2.4
28
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30
11
25
32
1.91
57944596--57944770
46
3.8
45
79
7
208
27
29
21
21
1.98
57944604--57944774
93
1.8
93
94
0
306
26
29
21
21
1.99
57944601--57944790
46
4.1
46
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18
135
27
29
21
22
1.99
57947307--57947535
88
2.6
87
76
4
235
32
25
25
16
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57952510--57952636
47
2.7
47
82
8
145
23
29
18
27
1.98
57959967--57960055
43
2.1
43
87
4
126
33
17
11
37
1.86
57965886--57965925
21
2.0
20
95
5
71
17
30
40
12
1.86
57967667--57967740
29
2.6
29
89
4
105
25
16
32
25
1.96
57969614--57969695
42
2.0
42
82
4
103
21
35
26
15
1.94
57974038--57974084
23
2.0
23
87
0
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31
4
0
63
1.13
57974172--57974231
25
2.5
24
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8
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31
0
1
66
1.01
57974175--57974231
26
2.3
24
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11
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31
0
1
66
1.02
57974172--57974221
26
2.0
25
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34
0
2
64
1.05
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40
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3
171
27
22
26
23
1.99
57978001--57978154
80
1.9
80
85
0
209
27
22
26
23
1.99
57978001--57978187
80
2.3
80
80
1
205
28
22
25
22
1.99
57981248--57981403
68
2.2
68
77
13
149
20
28
16
34
1.94
58003970--58004027
27
2.1
27
84
6
73
41
18
10
29
1.84
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21
1.9
20
85
10
53
22
22
20
35
1.96
58010690--58010747
27
2.1
27
84
6
73
41
18
10
29
1.84
58018057--58018094
19
2.0
20
85
15
53
39
23
0
36
1.55
58018324--58018494
93
1.8
93
91
0
279
29
28
20
22
1.98
58018319--58018491
46
3.7
46
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10
190
30
27
20
22
1.98
58018369--58018510
46
3.1
45
73
18
123
29
28
19
23
1.98
58022569--58022629
21
2.8
23
80
14
85
36
27
22
13
1.92
58022556--58022641
21
3.9
23
77
10
81
38
25
20
15
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58023012--58023065
15
3.8
15
74
20
62
51
11
0
37
1.37
58024370--58024398
8
3.6
8
100
0
58
62
0
0
37
0.96
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21
2.0
21
90
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42
2
7
47
1.43
58025693--58025757
29
2.2
29
100
0
130
64
6
3
26
1.32
58030776--58030904
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2.0
63
86
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181
24
28
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1.99
58039676--58039743
29
2.4
29
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77
19
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1.28
58043942--58043987
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2.0
23
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0
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13
1.48
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18
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0
0
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1.00
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9.9
20
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33
18
31
15
1.93
58047307--58047471
40
4.2
37
80
10
143
33
19
31
15
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378