Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  320  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97385784--97385821
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26
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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22
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97548058--97548200
47
3.0
47
89
5
198
28
21
22
27
1.99
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22
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22
23
1.93
97548392--97548516
61
2.0
62
96
1
234
38
16
22
23
1.93
97549225--97549318
40
2.3
40
81
0
107
23
21
27
27
1.99
97552726--97553168
47
9.4
47
91
1
672
36
8
27
27
1.86
97561518--97561604
43
2.0
43
80
12
99
24
19
28
27
1.98
97567228--97567287
30
2.0
30
93
0
102
38
6
25
30
1.81
97571208--97571366
26
6.2
26
91
0
257
32
8
23
35
1.85
97577050--97577209
26
6.2
25
87
9
232
32
7
24
35
1.83
97577050--97577209
80
2.1
76
90
4
248
32
7
24
35
1.83
97577050--97577209
54
3.1
53
89
8
240
32
7
24
35
1.83
97582637--97582678
21
2.0
21
100
0
84
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9
23
4
1.45
97584431--97584513
41
2.0
41
100
0
166
31
4
21
42
1.74
97588209--97588258
25
2.0
25
88
0
73
44
8
20
28
1.79
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26
2.4
27
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2
101
14
26
22
36
1.92
97596131--97596168
16
2.2
19
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55
63
5
0
31
1.17
97600772--97600817
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22
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0
4
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1.21
97602092--97602131
21
1.9
21
89
0
62
27
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30
22
1.98
97602588--97602631
12
3.7
12
85
11
63
20
9
13
56
1.64
97602577--97602628
18
2.9
18
85
5
61
19
11
11
57
1.63
97602577--97602628
6
8.7
6
77
8
52
19
11
11
57
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97602724--97602882
48
3.3
46
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8
210
27
15
16
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1.88
97602836--97603015
89
2.0
89
94
0
315
29
13
17
39
1.88
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28
2.3
28
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0
76
26
9
13
50
1.71
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3
16.3
3
82
4
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0
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0
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0
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0
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0.91
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0
21
0
0.76
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19
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0
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0
0.75
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0
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0
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1.89
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18
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22
43
1.88
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2.4
82
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18
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5
187
24
17
18
39
1.92
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2.8
13
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42
0
13
44
1.43
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10
5.1
10
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2
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23
5
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1.20
97621564--97621613
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2.5
20
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1.20
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1.89
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6
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6
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0
60
46
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15
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19
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51
0
0
48
1.00
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1
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77
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15
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20
1
0
78
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0
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125
2.0
125
96
0
459
29
16
21
32
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97634833--97634870
13
2.8
13
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4
58
42
0
13
44
1.43
97634885--97634936
10
5.1
10
83
2
50
25
5
1
67
1.23
97636723--97636772
2
25.5
2
95
4
93
52
0
0
48
1.00
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23
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63
50
0
2
47
1.13
97636908--97636947
21
1.9
21
85
10
55
50
0
2
47
1.14
97639522--97639578
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2.0
28
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0
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50
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15
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19
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0
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1.40
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26
2.7
26
88
0
104
47
11
12
28
1.77

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378