Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  16  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Indels
Score
A
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Entropy
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1.67
4396153--4396326
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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3
1
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1.27
4492599--4492713
60
1.9
60
96
3
214
50
3
1
44
1.29
4492712--4492779
35
2.0
34
82
8
84
50
1
2
45
1.26
4492556--4493001
150
3.0
147
92
2
752
47
2
2
47
1.28
4492746--4492896
60
2.6
59
82
7
177
48
2
1
47
1.27
4493343--4493396
21
2.6
21
81
0
81
53
33
1
11
1.47
4493377--4493431
28
2.0
28
82
13
69
56
16
1
25
1.50
4494109--4494143
17
2.0
17
88
5
52
65
14
0
20
1.26
4494321--4494348
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
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41
9.7
41
89
1
551
17
19
25
36
1.94
4499611--4499658
21
2.3
20
82
10
53
70
8
2
18
1.22
4506711--4506782
16
4.6
16
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1
101
27
25
5
41
1.77
4512950--4513162
37
5.9
37
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14
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28
27
13
30
1.94
4513066--4513162
33
2.9
33
74
9
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29
27
12
29
1.93
4518265--4518314
22
2.3
22
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6
57
66
0
14
20
1.26
4526421--4526486
33
2.0
33
100
0
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12
15
36
1.84
4532761--4532991
118
2.0
118
91
0
372
23
17
29
29
1.97
4533118--4533145
10
2.8
10
100
0
56
92
0
7
0
0.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
22
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8
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48
4
2
44
1.35
4536432--4536471
22
1.9
22
85
10
57
50
2
0
47
1.14
4541229--4541489
3
86.0
3
67
18
107
28
7
1
62
1.30
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11
2.4
11
100
0
52
26
11
0
61
1.30
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2.0
26
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14
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0
8
26
1.19
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21
2.2
21
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2
16
25
1.51
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4
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4
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6
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0
2
23
0.97
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2.1
15
100
0
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0
0
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11
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0
2
23
0.95
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3
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3
100
0
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34
0
0
65
0.93
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19
2.0
19
100
0
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15
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26
1.93
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13
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13
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29
6
27
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1.82
4546125--4546201
39
2.0
39
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5
111
29
6
27
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1.82
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17
1.9
17
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0
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48
0
6
45
1.27
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20
2.2
19
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4
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59
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7
26
1.50
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3
20.3
3
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63
0
4
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1.15
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3
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3
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1
6
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1.29
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19
2.1
19
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9
53
61
0
7
30
1.24
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11
2.4
11
100
0
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19
0
0
80
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44
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17
23
24
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4.6
87
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0
500
21
21
22
33
1.97
4553823--4554168
43
8.0
43
66
14
190
20
21
22
34
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4560858--4560906
7
7.0
7
79
9
55
14
2
2
81
0.87
4561799--4561832
2
17.5
2
93
6
61
50
0
0
50
1.00
4561802--4561831
15
2.0
15
100
0
60
53
0
0
46
1.00
4561800--4561832
17
1.9
17
100
0
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0
0
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1.00
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50
69
0
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24
1.10
4567802--4567830
15
1.9
15
100
0
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37
6
0
55
1.27
4567817--4567877
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28
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0
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2
0
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25
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0
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0
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2.4
20
75
10
51
44
11
0
44
1.39

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378