Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  252  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Number
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Score
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1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
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Period
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1.04
75584331--75584503
89
1.9
89
98
0
337
36
17
12
33
1.87
75586447--75586497
18
2.8
18
96
0
93
11
45
27
15
1.81
75596686--75596725
20
2.0
21
90
5
64
32
2
17
47
1.61
75603352--75603395
20
2.1
21
83
4
54
4
11
9
75
1.19
75603539--75603590
23
2.4
22
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15
63
57
1
1
38
1.21
75605272--75605337
33
2.0
33
93
0
114
24
21
15
39
1.91
75612508--75612586
40
2.0
40
100
0
158
32
10
22
34
1.88
75614207--75614239
16
2.1
16
100
0
66
39
12
18
30
1.87
75614819--75614846
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
75614908--75614966
23
2.5
24
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17
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44
1
1
52
1.21
75616749--75616926
21
8.5
21
72
7
128
15
20
19
44
1.86
75616752--75616926
42
4.2
42
85
1
217
14
20
19
45
1.86
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75
2.1
75
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0
302
23
26
24
25
2.00
75619782--75619836
27
2.0
27
96
0
101
50
1
18
29
1.57
75619789--75619847
27
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27
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0
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52
3
15
28
1.58
75620336--75620374
4
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4
100
0
78
74
0
25
0
0.82
75620903--75621100
21
9.4
20
65
9
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15
21
18
44
1.86
75620913--75621093
42
4.3
42
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2
220
16
21
18
43
1.88
75621583--75621639
27
2.1
27
86
0
78
19
7
28
45
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75622605--75622640
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2.0
18
100
0
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38
11
11
38
1.76
75623011--75623065
21
2.5
22
88
2
76
16
36
32
14
1.89
75624326--75624502
47
3.7
49
81
10
215
24
20
30
24
1.99
75624324--75624502
96
1.9
95
87
9
265
24
20
30
24
1.99
75630981--75631054
29
2.6
29
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27
32
14
25
1.95
75641208--75641248
21
1.9
22
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5
57
34
9
29
26
1.88
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31
2.0
31
100
0
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1.76
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16
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1.16
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2.1
19
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20
0
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1.34
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27
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169
24
19
19
37
1.94
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22
1.9
22
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5
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17
31
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9
1.82
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47
2.7
49
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2
170
24
30
18
26
1.98
75663014--75663231
47
4.6
47
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10
167
24
30
17
27
1.97
75663068--75663336
46
5.7
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72
13
185
24
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27
1.96
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2
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2
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0
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0
48
0
51
1.00
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0
11
0
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17
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9
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0
13
0
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0.58
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16.0
3
100
0
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33
0
0
66
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75675188--75675232
20
2.2
20
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54
48
8
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26
1.74
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2.9
16
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60
0
0
40
0.97
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2.0
50
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127
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15
0
40
1.53
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28
2.8
28
84
0
113
34
7
25
32
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75695511--75695589
28
2.8
28
83
11
108
35
10
25
29
1.88
75695815--75695853
17
2.3
17
95
0
69
43
5
7
43
1.55
75695996--75696075
33
2.4
33
91
4
108
42
2
26
28
1.68
75696014--75696090
33
2.3
33
88
4
111
41
2
25
29
1.69
75698159--75698259
28
3.5
28
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105
27
13
28
29
1.95
75701706--75702871
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48
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0
1927
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1.81
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16
100
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1.9
112
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0
370
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26
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35
1.81
75702872--75702971
48
2.1
48
90
0
155
31
26
7
36
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378