Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  55  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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3
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2
2
52
1.28
13944788--13944841
13
4.1
14
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18
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1
5
53
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1
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68
40
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56
1.16
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217
33
23
11
31
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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20
24
24
1.99
14007161--14007255
50
1.9
50
93
0
163
32
20
23
24
1.98
14009641--14009716
38
2.0
38
92
0
125
26
25
13
35
1.92
14022906--14022940
17
2.1
16
89
5
52
42
0
8
48
1.33
14022928--14022961
13
2.6
13
90
0
50
52
0
2
44
1.16
14028009--14028067
29
2.0
29
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9
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54
15
3
27
1.57
14028445--14028474
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
14029822--14029903
2
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2
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20
68
47
1
6
45
1.35
14030545--14030628
3
29.3
3
71
20
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2
4
28
1.26
14030551--14030623
26
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24
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19
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1
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27
1.22
14032538--14033055
89
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10
275
33
22
16
27
1.96
14032725--14032759
14
2.5
14
90
0
52
60
8
11
20
1.57
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2.9
89
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4
351
36
21
17
24
1.95
14032814--14032848
14
2.5
14
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0
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17
1.68
14032828--14033055
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29
22
19
28
1.98
14048046--14048082
2
18.5
2
100
0
74
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0
0
48
1.00
14048044--14048191
20
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22
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20
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50
3
7
38
1.47
14048177--14048252
24
3.0
25
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12
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56
3
5
34
1.40
14048728--14048811
3
29.3
3
71
20
56
63
2
4
29
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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24
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0
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37
2
20
39
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35
2.2
34
85
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96
38
4
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47
1.56
14058226--14058283
27
2.0
28
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12
73
48
10
12
29
1.73
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19
2.0
19
89
0
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47
0
2
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1.15
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16
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0
0
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20
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4
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1.42
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0
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1.61
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0
0
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0
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1.56
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2.0
15
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0
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126
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1
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26
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2.2
30
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7
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28
1.78
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7
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7
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0
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0
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0
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0
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30
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42
0
28
28
1.56
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2.1
31
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85
42
0
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31
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2.2
40
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100
0
182
19
24
27
28
1.99
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2.0
116
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17
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39
2.1
39
100
0
162
38
17
7
37
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14101043--14101188
73
2.0
73
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0
229
30
13
13
43
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33
2.0
33
85
5
89
33
37
6
22
1.79
14113666--14113727
24
2.6
24
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1
0
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2.1
30
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9
4
28
1.51
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26
2.5
26
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34
6
20
39
1.78
14122993--14123056
13
4.9
13
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58
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20
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1.78
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2.0
14
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0
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0
0
31
0.90
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20
2.2
20
84
8
54
40
9
11
38
1.73

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378