Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  249  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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80
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22
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2.00
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Period
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74443095--74443306
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2.7
80
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Indices
Period
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Score
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26
1.99
Indices
Period
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Copy
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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27
26
2.00
74597040--74597193
79
2.0
78
84
8
206
25
20
26
26
1.99
74599864--74599991
46
2.8
46
93
1
222
21
21
28
29
1.98
74602906--74602974
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
74602897--74602984
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
74605352--74605524
46
3.8
45
78
13
201
21
21
28
28
1.98
74608102--74608144
17
2.6
16
80
20
52
39
0
16
44
1.48
74614731--74614783
26
2.0
26
96
0
97
33
15
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33
1.90
74616538--74616668
50
2.6
50
87
8
187
26
29
18
25
1.98
74616487--74616849
46
7.7
48
75
10
254
25
29
18
26
1.98
74616501--74616849
140
2.4
140
77
14
349
25
29
18
26
1.98
74622635--74622753
46
2.6
46
84
6
143
31
17
26
24
1.97
74622920--74623292
189
2.0
189
98
0
728
27
13
25
32
1.94
74626249--74626420
93
1.8
93
91
2
283
28
29
20
21
1.98
74626243--74626417
46
3.8
46
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14
180
29
28
20
21
1.98
74626293--74626436
46
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43
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15
121
29
28
20
22
1.98
74634394--74634432
19
2.1
19
85
0
51
56
7
2
33
1.41
74639962--74640001
21
1.9
21
85
10
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37
7
0
55
1.29
74642187--74642345
68
2.3
69
89
5
230
12
33
4
49
1.61
74642810--74642836
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74646445--74646529
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2.0
43
95
0
152
30
11
27
30
1.92
74646947--74646979
17
1.9
17
93
0
57
39
0
0
60
0.97
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16
4.4
16
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0
97
30
25
7
36
1.83
74657305--74657347
23
1.9
22
90
4
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27
0
0
72
0.85
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2.2
23
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0
57
33
0
0
66
0.92
74658367--74658432
35
1.9
35
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3
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42
4
1
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1.31
74659458--74659500
21
2.0
22
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41
0
2
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1.12
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1.21
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27
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29
1.51
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2.0
137
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25
17
34
1.96
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18
2.2
18
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0
7
28
1.21
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2.5
58
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5
150
31
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1.97
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2.5
22
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11
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8
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30
1.94
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10
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20
20
30
28
1.98
74693696--74693866
93
1.8
93
94
0
306
20
21
30
28
1.98
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19
2.2
19
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0
55
12
29
31
26
1.92
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2.3
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1
319
34
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19
1.94
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2.3
70
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290
35
18
27
18
1.94
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3.0
41
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9
158
22
30
25
22
1.99
74739201--74739384
40
4.6
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27
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2.00
74739241--74739429
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74741767--74741916
39
3.8
39
91
0
237
24
22
31
22
1.98
74741767--74741945
39
4.6
39
87
1
232
24
22
30
22
1.99
74746062--74746225
40
4.1
40
82
4
179
25
28
21
25
1.99
74746048--74746225
80
2.2
80
82
3
207
24
27
21
25
2.00
74754173--74754336
40
4.1
40
81
4
161
25
28
21
25
1.99
74754159--74754336
80
2.2
80
80
3
189
24
27
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25
2.00
74761742--74762035
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2.0
147
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0
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134
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339
28
23
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1.84
74765203--74765250
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378