Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  84  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22790223--22790278
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18
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22790210--22790299
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2.5
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3.5
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3.5
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2.7
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1.93
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2.7
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156
22
28
19
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
19
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0
0
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2
4
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1.29
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3.2
56
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188
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10
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1.68
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30
2.0
30
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30
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1.95
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18
28
23
1.98
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4.7
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156
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17
28
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1.98
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93
3.8
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528
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1.97
22884747--22885105
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355
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17
29
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1.97
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3.8
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20
21
29
28
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20
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1.98
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3.8
46
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12
216
20
21
29
28
1.98
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93
1.8
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20
21
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1.98
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242
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23
1.98
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2
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2
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1.32
22911435--22911510
37
2.1
37
92
2
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11
83
0
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36
17
17
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23
2.0
23
86
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60
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15
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19
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85
65
13
2
19
1.37
22934108--22934362
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5.5
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1
352
21
22
15
40
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16
2.5
16
95
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20
25
20
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1.96
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11
4.7
11
76
9
52
63
3
0
32
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
0
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1.12
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2.4
19
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56
68
0
28
2
1.01
22942108--22942303
25
7.8
25
91
1
313
23
25
19
31
1.98
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22
84
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18
24
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42
1.88
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26
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52
1
15
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1.50
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53
100
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220
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2
14
32
1.57
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27
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27
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48
2
14
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1.56
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18
7.7
18
83
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37
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1.86
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54
3.1
53
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3
183
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10
15
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1.82
22948114--22948281
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0
75
0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22993851--22993930
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2.2
35
82
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18
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10
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25
31
1.97
23002380--23002459
28
2.8
29
82
3
90
20
17
17
45
1.86
23005745--23005880
26
5.2
26
94
0
218
34
4
23
37
1.75
23007055--23007086
8
4.0
8
91
0
55
46
25
25
3
1.67
23007499--23007638
27
5.2
27
87
5
176
18
24
22
35
1.96
23013422--23013475
20
2.7
20
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11
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57
0
0
42
0.98
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15
2.1
15
100
0
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16
32
0
51
1.44
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29
2.9
29
100
0
166
30
14
28
26
1.95
23027618--23027754
60
2.3
58
81
6
152
28
15
31
24
1.95
23035721--23035786
29
2.2
29
89
5
96
33
16
27
22
1.96
23037261--23037314
27
2.0
27
100
0
108
37
18
25
18
1.94
23038857--23038895
14
2.9
14
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3
53
15
5
0
79
0.90
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14
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15
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0
5
18
0.97
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20
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1.90
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2.1
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0
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2.0
31
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0
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32
1.21
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15
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15
100
0
58
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0
68
1.13
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11
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0
53
32
0
0
67
0.91
23076809--23076871
22
2.9
21
83
7
63
73
1
7
17
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23078466--23079285
44
18.1
44
73
9
518
28
20
17
33
1.95
23078477--23079285
229
3.5
226
77
7
692
28
20
17
33
1.95
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51
4.5
51
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18
152
30
19
16
33
1.94
23078797--23079285
140
3.5
139
81
4
526
29
20
17
32
1.95
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34
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0
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20
1.92
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0
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66
0
2
30
1.05
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22
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72
1
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18
1.16
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17
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17
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23
53
43
3
0
52
1.18
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3.5
33
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144
39
4
0
54
1.27
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2.4
28
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20
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1
0
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1.10
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100
0
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32
0
35
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1.58
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9
5.3
9
78
7
55
80
2
2
16
0.91
23093269--23093324
18
3.0
19
75
17
55
58
5
1
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1.31
23093290--23093320
15
2.0
16
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6
55
61
6
0
32
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20
2.2
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28
2
0
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26
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184
33
5
24
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26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
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136
2.1
135
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410
25
18
25
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26
4.2
26
91
4
184
33
4
25
37
1.76
23104894--23105001
50
2.1
51
93
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182
33
4
25
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1.76
23106482--23106533
25
2.0
26
85
3
70
38
23
13
25
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23106780--23107066
137
2.1
137
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556
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1.98
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2.9
14
92
0
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46
29
0
24
1.53
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2.0
21
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0
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21
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0
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50
32
0
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1.47
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26
100
0
112
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20
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22
2.0
22
91
8
74
33
6
6
53
1.53

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378