Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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This is table  201  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.4
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2
169
26
29
16
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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28
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27
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.96
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1.97
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19
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1.97
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16
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37
20
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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1.99
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69
12
69
17
21
20
41
1.91
59574108--59574208
28
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12
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20
25
25
1.99
59574136--59574206
33
2.1
34
92
2
117
28
21
26
23
1.99
59575066--59575095
16
1.9
15
93
6
51
33
23
0
43
1.54
59575300--59575529
49
4.6
49
76
7
187
29
27
16
26
1.97
59578573--59578622
20
2.3
23
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59578573--59578625
23
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25
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32
9
13
45
1.75
59582320--59582364
21
2.2
21
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59582320--59582363
20
2.2
20
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59602932--59603045
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2.7
43
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2
158
31
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1.96
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40
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1.99
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2.1
23
100
0
98
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4
28
40
1.74
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40
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40
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278
24
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26
28
1.99
59615999--59616207
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1.99
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1.9
18
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0
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28
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24
24
2.00
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10.8
50
75
10
440
26
17
30
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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95
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17
30
25
1.97
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2.3
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16
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1.95
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44
2.7
42
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2
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1.97
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25
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1.99
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25
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1.99
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1.8
101
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0
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1.97
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1.97
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25
2.00
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4.9
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1.98
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123
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40
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24
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26
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39
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29
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1.99
59710857--59710955
39
2.5
40
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28
23
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1.99
59710804--59710988
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25
24
27
22
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2.0
17
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5
59
21
6
0
72
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59717748--59717775
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13
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0
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0
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0
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9
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2.9
48
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1
197
29
24
21
24
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378