Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  71  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18585912--18586058
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55
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265
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20
27
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1.99
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1.9
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22
2.0
22
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2
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21
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173
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22
21
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1.97
18615202--18615902
44
16.1
43
64
14
251
22
21
21
34
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18615228--18615902
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22
21
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1.97
18620596--18620641
9
4.8
10
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10
17
21
1.77
18620596--18620641
19
2.4
19
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10
17
21
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2
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35
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2.1
25
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32
1.45
18625124--18625176
25
2.2
24
83
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63
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18639255--18639363
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4.2
26
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184
33
5
24
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18645012--18645120
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4.2
26
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175
33
5
24
35
1.79
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25
2.6
25
90
0
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1.94
18656267--18656303
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70
2
21
5
1.20
18656267--18656319
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2.1
26
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72
71
1
22
3
1.12
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20
1.99
18658267--18658457
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39
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1
256
28
27
23
19
1.99
18658226--18658459
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78
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252
30
27
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19
1.98
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5.7
24
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0
166
33
31
12
22
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
25
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1.99
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1.9
118
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1.99
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1.91
18665173--18665236
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24
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1.91
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22
26
22
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18744870--18745015
40
3.7
40
83
0
166
23
27
21
26
1.99
18744902--18745053
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3.8
40
83
3
162
22
26
22
28
1.99
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20
1.84
18758122--18758152
7
4.3
7
92
8
53
12
0
0
87
0.55
18758122--18758152
15
2.1
15
100
0
62
12
0
0
87
0.55
18768258--18768306
4
12.2
4
87
8
73
75
0
0
24
0.80
18768905--18768929
12
2.1
12
100
0
50
0
16
8
76
1.02
18773528--18773611
40
2.1
39
86
2
114
29
28
15
26
1.96
18783305--18783334
15
2.0
15
93
0
51
6
10
13
70
1.34
18796709--18796735
14
1.9
14
100
0
54
29
7
0
62
1.22
18796793--18797060
3
88.3
3
67
16
101
28
7
1
61
1.34
18801325--18801367
2
22.0
2
95
4
79
48
0
0
51
1.00
18806357--18806397
18
2.3
18
87
4
57
14
12
19
53
1.72
18808164--18808229
35
1.9
34
84
9
89
37
0
0
62
0.96
18808258--18808300
15
2.8
15
86
10
52
27
2
0
69
1.00
18814442--18814482
5
7.8
5
91
8
64
80
2
17
0
0.82
18815445--18815883
45
9.9
45
85
7
524
29
19
25
25
1.98
18817759--18817826
36
1.9
35
84
3
91
36
1
0
61
1.05
18817786--18817836
26
2.0
24
81
7
57
37
1
0
60
1.08
18818102--18818167
3
22.0
3
100
0
132
33
0
0
66
0.92
18821735--18822057
84
4.0
83
78
8
313
35
16
25
21
1.94
18821823--18821962
75
1.9
75
93
0
244
37
16
21
24
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18821739--18822043
159
1.9
159
85
1
414
36
16
24
22
1.94
18822650--18822694
22
2.0
22
100
0
90
44
8
0
46
1.34
18823024--18823184
78
2.1
78
95
0
286
40
13
17
29
1.87
18823566--18823710
75
1.9
75
87
0
209
23
22
15
39
1.91
18823641--18823809
93
1.8
93
88
0
257
23
27
17
31
1.96
18833797--18833944
42
3.5
42
83
0
161
29
13
25
32
1.94
18835371--18835449
39
2.0
39
100
0
158
26
20
20
32
1.97
18841196--18841308
42
2.7
42
91
0
172
28
25
15
30
1.95
18841277--18841402
47
2.7
46
83
2
162
28
24
16
30
1.97
18841420--18841568
31
4.8
31
91
0
235
26
28
19
25
1.99
18841544--18841720
50
3.5
50
89
0
273
24
21
16
36
1.94
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29
2.0
29
100
0
116
37
17
13
31
1.89
18844023--18844054
5
6.6
5
92
7
57
81
0
0
18
0.70
18844024--18844054
9
3.3
9
95
4
53
80
0
0
19
0.71
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5
6.6
5
92
7
57
81
0
0
18
0.70
18848467--18848497
9
3.3
9
95
4
53
80
0
0
19
0.71
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21
2.0
21
85
0
55
70
2
17
9
1.25
18853706--18853760
3
18.3
3
100
0
110
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0
0
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14
2.1
15
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66
0
0
33
0.92
18859837--18859869
5
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5
100
0
66
18
0
0
81
0.68
18865467--18865530
22
2.8
23
90
7
103
68
0
23
7
1.15
18872489--18872615
27
4.6
27
81
2
119
18
22
22
36
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18872514--18872629
28
4.3
27
86
6
155
15
23
22
38
1.92
18872514--18872619
55
1.9
55
88
7
162
16
23
21
37
1.93
18879051--18879080
8
3.8
8
90
0
51
43
26
26
3
1.70
18879469--18879580
27
4.2
26
85
7
134
17
24
22
35
1.95
18879469--18879580
54
2.1
54
86
3
154
17
24
22
35
1.95
18885103--18885163
23
2.7
23
87
2
88
44
42
1
11
1.50
18887840--18887920
23
3.4
23
78
6
90
45
35
3
14
1.63
18890443--18890483
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3
80
14
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63
0
4
31
1.15
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22
2.5
22
82
5
67
27
20
20
32
1.97
18906272--18906323
25
2.0
26
85
3
70
25
23
0
51
1.48

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378