Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  169  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.0
30
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10
17
15
56
1.66
49262813--49262993
46
3.9
46
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9
233
20
21
29
27
1.98
49262815--49262985
93
1.8
93
96
0
315
20
22
29
27
1.98
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26
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0
189
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Indices
Period
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Copy
Number
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2.0
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18
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58
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2.3
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2.4
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1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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2
31
1.41
49339900--49339943
19
2.4
19
85
7
56
59
2
2
36
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
49340308--49340359
3
17.3
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0
95
67
1
0
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1.02
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14
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22
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6
4
44
1.52
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2.5
16
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4
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23
0
0
76
0.78
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2.2
20
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2
0
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7
100
0
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11
0
59
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21
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27
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1.84
49361094--49361343
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3.1
81
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0
347
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22
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39
1.83
49361318--49361460
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5.3
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9
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7
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1.81
49361308--49361482
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203
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24
1.97
49361504--49361744
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4.5
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5
317
33
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24
1.97
49361507--49361744
80
3.0
79
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33
19
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25
1.97
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3.0
22
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23
21
33
1.97
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26
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5
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22
18
38
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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6
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19
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19
17
15
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1.81
49362632--49362767
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31
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19
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2.8
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1.95
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2.00
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164
24
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25
2.00
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37
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30
17
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74
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38
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10
293
46
10
9
33
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.8
141
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0
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10
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3.8
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44
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10
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66
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21
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0
51
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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