Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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This is table  72  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18923595--18923783
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1
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0
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0
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0
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0
0
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0.95
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2.0
17
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2
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18
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2.5
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17
8
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23
28
19
29
1.98
18980360--18980716
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390
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1.98
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12
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0
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1.58
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2.4
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2.3
13
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2.1
44
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0
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19
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2.0
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2.0
25
100
0
102
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3
27
9
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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21
1.98
19003036--19003204
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1.8
92
94
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304
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29
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21
1.98
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2.0
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30
25
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1.8
93
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0
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29
21
21
1.98
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3.7
46
80
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219
28
28
21
21
1.98
19011159--19011218
30
2.0
30
90
0
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30
25
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1.85
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2.5
15
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0
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2
0
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1.11
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2.1
29
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0
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22
1.78
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22
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22
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21
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142
37
23
22
16
1.93
19043523--19043638
54
2.1
54
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162
37
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22
16
1.93
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4
34
1.75
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19
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10
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23
10
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1.97
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177
3.6
177
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19
22
26
1.97
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11
4.3
11
76
19
55
36
2
2
59
1.21
19060671--19060708
15
2.5
15
86
0
58
36
2
0
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1.11
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18
2.1
18
100
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36
5
21
36
1.76
19063602--19063759
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1.9
83
89
2
248
43
2
3
50
1.33
19063689--19063728
21
2.0
20
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53
40
0
2
57
1.12
19063744--19063779
19
1.9
18
88
5
54
52
2
0
44
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19075745--19075775
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0
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1.00
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3.0
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2
7
45
1.45
19077831--19077878
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2.0
25
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2
6
39
1.39
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19
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18
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16
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10
8
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1.71
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0
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0
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13
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0
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2.0
52
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201
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19
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1.8
103
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25
1.95
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2.2
20
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0
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27
23
13
34
1.93
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20
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82
25
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1.90
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21
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16
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1.90
19098338--19098421
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2.0
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107
23
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28
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20
19
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1.97
19117745--19117863
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53
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5
10
50
1.59
19134454--19134494
14
2.9
15
78
14
50
39
14
0
46
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19138554--19138586
3
11.0
3
93
0
57
36
0
0
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0.95
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2
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0
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50
0
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47
1.16
19177980--19178005
9
2.9
9
100
0
52
23
0
0
76
0.78
19182269--19182346
33
2.4
32
81
10
86
30
14
24
30
1.94
19182233--19182450
102
2.1
101
87
4
323
30
12
24
31
1.93
19190083--19190316
74
3.2
74
75
6
271
31
23
22
22
1.98
19190014--19190318
35
8.6
35
71
8
150
32
22
21
23
1.98
19190014--19190324
143
2.2
142
86
1
426
32
22
21
23
1.98
19190460--19190532
36
2.0
36
82
10
87
39
20
1
38
1.61
19192013--19192046
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
19194579--19194688
42
2.6
42
81
4
132
31
20
21
25
1.98
19196176--19196276
50
2.0
50
84
0
130
38
29
6
24
1.82
19196371--19196435
32
2.0
32
100
0
130
44
12
12
30
1.79
19200343--19200383
21
2.0
21
95
0
73
46
26
9
17
1.79
19203317--19203349
14
2.2
16
89
10
52
63
0
9
27
1.24
19209493--19209526
10
3.3
11
88
12
54
50
0
5
44
1.26
19213931--19214030
42
2.4
42
86
3
130
42
15
25
18
1.88
19213965--19214032
21
3.2
21
68
0
55
44
16
22
17
1.87
19220961--19221043
38
2.4
34
79
16
98
19
22
37
20
1.94
19220974--19221052
38
2.1
38
97
0
149
18
26
36
17
1.94
19221035--19221067
17
1.9
17
93
0
57
12
27
45
15
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19221519--19221597
40
2.0
40
84
0
104
16
16
31
35
1.91
19225217--19225252
18
2.1
18
94
5
65
11
25
44
19
1.83
19231999--19232054
27
2.1
27
100
0
112
35
3
17
42
1.67
19234631--19234743
42
2.7
42
87
4
158
32
27
10
29
1.90
19234702--19234824
47
2.7
46
87
1
165
30
27
14
27
1.95
19234850--19234967
31
3.8
31
93
0
191
24
27
20
27
1.99
19234943--19235119
50
3.5
50
89
3
266
26
22
15
35
1.94
19237916--19237953
17
2.3
17
86
4
51
52
2
0
44
1.14
19238398--19238470
24
2.8
28
74
18
75
60
0
4
35
1.16
19243558--19243744
95
2.0
95
94
0
329
43
9
16
30
1.79
19246822--19246854
16
2.1
16
94
0
57
0
39
0
60
0.97
19257197--19257260
30
2.1
30
85
8
85
45
14
18
21
1.85
19260523--19260835
156
2.0
156
89
1
484
29
19
18
32
1.96
19263896--19263992
48
2.0
48
97
0
185
41
25
6
26
1.79
19269696--19269724
15
1.9
15
100
0
58
37
20
13
27
1.91
19270499--19270536
3
12.7
3
100
0
76
65
0
34
0
0.93
19272342--19272384
21
2.2
20
83
8
52
58
4
4
32
1.39
19274033--19274081
25
2.0
25
83
0
62
38
0
16
44
1.48
19274504--19274542
15
2.6
15
84
11
53
58
0
17
23
1.38
19274476--19274562
43
2.0
43
90
0
138
55
1
20
22
1.51
19276401--19276449
22
2.1
24
85
7
66
24
2
24
48
1.61
19278121--19278170
23
2.2
23
92
0
82
22
24
20
34
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19278158--19278219
23
2.7
23
79
0
70
24
20
20
33
1.97
19284948--19285051
2
52.0
2
94
0
181
50
47
0
2
1.16
19287425--19287459
3
11.7
3
100
0
70
34
0
65
0
0.93
19288167--19288533
46
8.0
46
89
0
473
40
14
22
21
1.90
19288418--19288492
24
3.2
24
62
24
59
41
16
24
18
1.90
19291215--19291283
26
2.7
24
76
12
66
31
15
27
24
1.96
19292998--19293024
12
2.2
12
100
0
54
25
7
25
40
1.82
19298650--19298726
38
2.0
38
94
0
136
29
6
27
36
1.82
19300434--19300497
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2.0
32
93
0
110
35
14
20
29
1.92
19307701--19307760
30
2.0
30
90
0
93
36
25
20
18
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378