Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  95  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
92
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1.89
25858193--25858396
92
2.2
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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22
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28
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2.0
22
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23
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142
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18
31
22
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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2.0
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16
32
18
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4
223
27
25
13
33
1.94
26106871--26107030
29
5.5
30
88
8
222
27
25
13
33
1.94
26106871--26107030
59
2.8
57
89
4
223
27
25
13
33
1.94
26110143--26110237
44
2.2
44
94
3
165
23
8
23
45
1.80
26110577--26110854
138
2.0
138
97
0
529
22
14
20
43
1.87
26113776--26113812
16
2.2
17
90
4
58
54
0
2
43
1.14
26114199--26114271
9
8.2
9
74
8
51
65
1
1
31
1.09
26114205--26114262
17
3.2
18
83
11
66
68
1
1
27
1.08
26114205--26114271
18
3.8
17
79
15
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68
1
1
28
1.07
26114199--26114272
26
2.7
27
83
6
87
66
1
1
31
1.09
26115132--26115175
22
2.0
22
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0
70
38
0
20
40
1.53
26116230--26116269
19
2.1
19
100
0
80
47
0
5
47
1.24
26116303--26116360
3
19.3
3
100
0
116
65
0
0
34
0.93
26124435--26124528
25
3.7
26
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2
95
21
25
18
35
1.95
26124468--26124573
25
4.3
25
78
1
97
21
23
19
34
1.96
26127213--26127251
5
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5
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0
17
41
1.50
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26
2.9
25
75
15
69
20
20
21
36
1.95
26127681--26127762
25
3.2
26
80
13
82
19
20
23
36
1.95
26127705--26127762
26
2.3
26
85
8
75
20
18
22
37
1.94
26127791--26127859
24
2.8
24
77
14
70
21
21
20
36
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26127723--26127862
25
5.7
24
71
14
79
18
22
21
37
1.94
26129228--26129266
20
2.0
20
89
0
60
23
2
17
56
1.53
26132939--26132989
15
3.4
15
82
15
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50
5
1
41
1.37
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22
2.0
22
90
0
70
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0
0
45
0.99
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22
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45
0
0
54
0.99
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13
2.9
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54
0
0
45
0.99
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2.3
16
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13
58
59
0
0
40
0.97
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31
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0
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10
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37
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8
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23
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24
1.98
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152
2.6
153
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5
472
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22
20
26
1.98
26135529--26135573
14
3.2
14
78
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26
0
24
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1.51
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14
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14
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18
0
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13
2.4
14
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37
0
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1.34
26139614--26139663
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2.4
21
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0
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18
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43
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2
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26
27
15
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1.96
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13
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13
100
0
50
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0
0
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0.90
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21
2.8
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0
82
32
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32
27
1.87
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15
2.1
15
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0
53
51
0
0
48
1.00
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2.0
34
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2
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20
2.6
21
82
11
67
37
0
5
57
1.22
26151572--26151620
3
17.3
3
76
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28
2
0
69
1.00
26151576--26151614
11
3.5
11
92
0
69
28
2
0
69
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26151572--26151613
19
2.2
19
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8
59
26
2
0
71
0.98
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46
6.0
46
89
0
352
40
14
24
21
1.90
26159354--26159520
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
26159354--26159520
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
26160345--26160390
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
26176202--26177005
210
3.8
210
87
3
1083
30
18
21
29
1.96
26179001--26179038
20
1.9
19
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5
67
36
5
5
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1.47
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37
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2
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1.53
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2.0
41
95
0
148
51
14
19
14
1.76
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40
5.5
40
93
1
359
26
28
22
22
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378