Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  371  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110904982--110905026
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0
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0
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144
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18
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0
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1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
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2
1
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1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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1.96
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2.5
51
88
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190
35
17
20
25
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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44
13
27
13
1.82
111028263--111028388
47
2.7
48
86
2
166
29
15
25
29
1.96
111035383--111035426
21
2.2
20
88
12
63
38
0
4
56
1.20
111036555--111036601
17
2.8
16
78
15
51
34
2
2
61
1.20
111038428--111038487
30
2.0
30
100
0
120
23
20
16
40
1.91
111039365--111039403
16
2.3
16
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8
51
43
5
2
48
1.38
111041652--111042166
256
2.0
256
99
0
1012
29
20
18
30
1.97
111048216--111048302
36
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36
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3
1.34
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12
100
0
60
10
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0
46
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12
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12
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0
63
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111059160--111059591
187
2.3
186
82
8
524
26
15
22
35
1.94
111059330--111059511
66
2.7
66
79
15
194
24
14
22
38
1.91
111059465--111059565
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1.9
54
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6
145
25
14
19
39
1.90
111060967--111061081
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
111060967--111061100
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
111067101--111067215
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
111067101--111067234
46
3.0
45
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4
153
35
14
23
26
1.93
111073237--111073351
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
111073237--111073370
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
111076153--111076260
26
4.2
26
92
0
180
38
24
4
32
1.76
111076984--111077082
49
2.0
50
82
7
121
53
16
4
26
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111078510--111078543
15
2.4
14
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5
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29
8
35
26
1.87
111080121--111080178
27
2.1
27
83
0
71
39
20
5
34
1.75
111082278--111082516
109
2.2
110
83
2
320
22
19
16
41
1.91
111094889--111094970
26
3.2
25
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10
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48
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2
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1.9
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0
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0
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0
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2.3
21
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3
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0
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0
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0
0
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19
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0
0
40
1.11
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10
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0
0
10
90
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100
0
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0
0
48
1.00
111125220--111125317
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10
112
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2
31
1.29
111125461--111125541
23
3.5
24
71
24
59
51
3
0
44
1.19
111125464--111125544
22
3.5
22
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12
65
53
3
0
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1.18
111128121--111128148
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2.2
13
100
0
56
50
7
0
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1.30
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30
3.8
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0
194
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3
21
1.65
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25
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25
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16
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33
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4
56
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16
3.1
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31
2
2
64
1.16
111130858--111130909
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8
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30
1
1
65
1.14
111132424--111132459
12
3.0
12
95
0
63
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25
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1.77
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217
28
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22
34
1.93
111140879--111141030
72
2.1
71
89
4
234
23
14
22
40
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111140977--111141602
140
4.5
140
96
1
1157
25
16
20
37
1.93
111141299--111141323
13
1.9
13
100
0
50
24
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0
64
1.27
111141441--111141474
13
2.5
13
90
4
50
20
11
8
58
1.59
111141513--111141742
72
3.1
72
83
11
268
31
16
17
35
1.92
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2.0
49
97
0
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1.95
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120
2.0
121
93
0
408
30
16
18
34
1.93
111141748--111142099
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1.94
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193
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537
32
15
17
34
1.91
111142021--111142192
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1.8
93
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247
27
20
19
31
1.97
111142114--111142913
77
10.0
76
74
14
542
27
17
19
35
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378