Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  307  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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Copy
Number
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Indels
Score
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C
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28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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15
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1.66
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81
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232
20
21
29
28
1.98
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1.8
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96
0
317
20
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30
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1.98
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21
29
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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1.99
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40
5.1
40
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268
22
20
29
27
1.98
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28
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1.99
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19
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0
53
38
12
20
28
1.89
93323820--93323981
81
2.0
81
98
0
315
32
17
8
41
1.80
93324763--93324945
79
2.3
81
84
7
232
26
27
21
24
1.99
93324761--93324945
40
4.7
40
82
9
218
26
28
21
23
1.99
93326135--93326246
51
2.2
51
80
6
120
18
18
13
49
1.80
93332730--93332912
79
2.3
81
85
7
241
25
27
22
24
2.00
93332709--93332912
40
5.1
40
83
8
247
25
27
22
24
1.99
93334155--93334180
10
2.6
10
100
0
52
0
19
0
80
0.71
93334145--93334182
16
2.4
16
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8
60
0
18
0
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2.1
63
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157
15
19
11
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1.71
93338211--93338261
20
2.8
18
80
16
52
25
25
0
49
1.51
93346978--93347140
39
4.2
39
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0
263
23
20
31
24
1.98
93346978--93347170
39
4.9
39
90
0
251
23
21
31
23
1.98
93354961--93355122
39
4.2
39
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1
245
22
19
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24
1.97
93359165--93359209
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17
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62
4
2
31
1.27
93360441--93360483
22
2.0
22
95
0
77
39
11
4
44
1.62
93363944--93364132
55
3.5
54
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5
229
34
19
23
22
1.97
93363936--93364143
53
3.9
54
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6
233
34
18
23
23
1.96
93369659--93369692
18
1.9
17
88
5
50
8
14
8
67
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93371676--93371826
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3.8
40
80
6
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26
23
27
23
2.00
93379703--93379832
40
3.3
39
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11
147
23
23
26
25
2.00
93382076--93382114
20
2.0
20
100
0
78
35
12
20
30
1.90
93382166--93382281
23
4.9
24
92
6
177
25
21
24
28
1.99
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2.1
31
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0
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15
23
23
1.93
93394973--93395225
133
1.9
133
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348
34
21
18
24
1.96
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3
17.0
3
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67
1
0
30
1.02
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13
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56
1
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1.25
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2.0
16
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0
55
56
0
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1.15
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12
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14
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50
7
0
42
1.31
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24
2.4
24
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0
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61
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26
1.42
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79
2.1
78
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218
16
32
10
39
1.83
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29
2.0
29
100
0
118
27
6
10
55
1.58
93399094--93399230
69
2.0
69
89
0
211
36
21
12
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1.90
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3.5
14
80
11
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4
4
23
1.26
93407190--93407227
13
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13
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42
0
13
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1.43
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10
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10
80
7
59
25
6
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65
1.33
93430224--93430267
20
2.2
20
96
4
81
52
20
13
13
1.74
93432735--93432772
20
1.9
20
88
0
58
55
5
2
36
1.37
93434893--93435028
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4.7
29
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7
116
44
10
25
19
1.83
93434892--93435028
58
2.4
58
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143
44
10
25
19
1.82
93434979--93435046
29
2.3
29
82
0
82
45
13
23
17
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93437120--93437329
46
4.6
45
82
5
201
17
20
17
44
1.86
93439434--93439504
26
2.8
25
80
4
79
35
16
5
42
1.72
93439646--93439684
6
6.5
6
88
11
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15
28
0
56
1.40
93439646--93439684
11
3.2
12
89
10
62
15
28
0
56
1.40
93443778--93443814
16
2.4
16
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4
58
35
16
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1.94
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2.0
26
100
0
104
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26
2.0
27
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196
28
28
20
21
1.98
93455567--93455741
46
3.8
48
78
14
179
29
28
21
21
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378