Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr01 113035596 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  27  of  378  ( 45343 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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25
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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(0-2)
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0.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
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Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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24
1.91
6743546--6745859
454
5.0
454
84
5
2946
31
16
16
35
1.91
6744785--6744856
36
2.0
36
100
0
144
27
2
16
52
1.57
6747216--6747255
2
20.0
2
100
0
80
50
0
0
50
1.00
6751782--6751827
21
2.1
23
84
8
60
30
2
4
63
1.26
6756183--6756215
16
1.9
18
88
11
52
6
21
6
66
1.35
6757111--6757349
43
5.6
42
70
8
151
19
23
23
33
1.97
6757114--6757352
86
2.8
87
85
3
322
19
23
24
32
1.98
6757152--6757305
44
3.6
42
77
9
152
17
25
22
33
1.96
6757440--6757605
66
2.5
65
86
1
226
38
10
19
31
1.86
6765538--6765578
19
2.1
20
86
4
57
48
7
17
26
1.73
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33
2.2
30
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9
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52
2
5
38
1.40
6773244--6773275
14
2.1
16
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65
0
6
28
1.16
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3
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100
0
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0
0
34
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3
25.3
3
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0
143
67
1
0
31
0.99
6774133--6774160
11
2.5
11
100
0
56
14
0
7
78
0.95
6774543--6774611
35
2.0
35
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0
120
21
10
49
18
1.77
6776803--6776924
46
2.7
46
94
0
208
42
23
9
24
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6777877--6777937
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1.9
32
93
0
104
49
18
4
27
1.68
6777877--6777950
32
2.5
30
85
10
91
50
18
4
27
1.65
6777910--6777964
27
2.0
27
86
6
76
49
18
5
27
1.69
6780091--6780133
22
2.0
22
95
0
77
48
11
4
34
1.60
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21
2.7
21
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5
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71
3
3
21
1.17
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21
1.9
21
89
0
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2
2
20
1.04
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26
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0
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5
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1.78
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2.1
137
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0
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18
24
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1.97
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2
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21
12
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1.88
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16
2.8
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0
0
39
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2.4
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5
171
27
21
11
39
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14
2.1
14
100
0
58
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6
20
1.70
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30
23
20
25
1.98
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17
3.8
19
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22
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21
2
1
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1.03
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21
2
1
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1.03
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15
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2
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2
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0
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0
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50
0
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2.1
27
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103
47
14
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30
1.71
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29
2.0
29
100
0
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10
10
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31
2.0
31
100
0
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3
32
1.49
6819630--6819681
18
3.2
15
76
23
52
26
3
0
69
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6828373--6828428
20
3.0
19
71
10
53
16
8
0
75
1.05
6834712--6834765
11
5.3
10
80
6
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40
1
14
42
1.57
6835145--6835190
23
2.1
21
84
8
56
45
0
0
54
0.99
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26
3.3
26
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0
154
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5
24
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1.79
6841294--6841346
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
6842913--6842967
21
2.5
21
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18
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1
3
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1.29
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21
2.0
21
90
0
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20
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20
100
0
84
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1.91
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29
2.4
29
81
16
81
36
0
4
59
1.17

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378