Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  296  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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28
1.98
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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1.9
101
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23
1.93
Indices
Period
Size
Copy
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Score
A
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(0-2)
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14
17
35
1.91
89608231--89608401
93
1.8
93
96
0
315
28
29
21
21
1.98
89608226--89608398
46
3.8
45
80
10
215
28
28
21
21
1.98
89609877--89610092
46
4.6
46
78
7
195
25
28
17
29
1.97
89611986--89612030
21
2.1
21
91
0
72
28
24
2
44
1.66
89614333--89614393
30
2.0
30
93
6
106
3
29
14
52
1.58
89628159--89628345
68
2.8
68
78
3
171
25
22
17
34
1.95
89630647--89630679
16
2.1
16
88
5
50
60
3
18
18
1.49
89631826--89631901
33
2.3
33
86
0
98
34
18
22
25
1.96
89631687--89631879
105
1.9
101
82
6
244
32
15
25
26
1.96
89631922--89631978
30
1.9
30
88
0
87
29
15
29
24
1.96
89641570--89641679
46
2.4
44
78
10
123
24
28
18
29
1.98
89641651--89641779
47
2.8
45
80
12
129
24
29
16
29
1.96
89644142--89644185
7
6.1
7
80
15
54
25
2
0
72
0.96
89646866--89646928
31
2.0
31
81
6
74
47
1
0
50
1.10
89648747--89648808
28
2.2
28
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0
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25
29
24
20
1.99
89650290--89650469
31
5.8
31
87
2
254
28
27
16
27
1.97
89650449--89650573
50
2.5
51
88
2
180
26
25
14
33
1.94
89654270--89654311
16
2.6
16
81
11
50
45
4
4
45
1.45
89660778--89660906
64
2.0
63
92
1
213
42
8
23
25
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89661768--89662668
263
3.5
259
80
7
898
36
18
11
33
1.88
89668458--89668502
19
2.3
20
81
14
58
6
4
24
64
1.37
89673308--89673482
46
3.8
45
80
11
203
20
21
29
29
1.98
89673305--89673475
92
1.9
92
94
0
306
20
21
29
28
1.98
89680840--89681015
46
3.8
46
74
15
182
21
20
28
29
1.98
89680837--89681008
93
1.8
93
92
2
292
21
20
29
28
1.98
89689890--89690550
329
2.0
329
98
0
1286
25
19
18
36
1.94
89703867--89703913
24
2.0
23
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4
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76
2
0
21
0.89
89703876--89703940
17
3.9
16
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13
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76
1
0
21
0.86
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16
3.8
16
76
17
58
76
1
0
22
0.88
89703876--89703930
19
3.1
18
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10
69
76
1
0
21
0.88
89703888--89703930
19
2.2
20
91
4
70
76
0
0
23
0.78
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27
2.0
28
83
12
73
70
0
0
29
0.88
89704203--89704281
31
2.6
30
74
11
72
39
15
5
40
1.69
89705605--89705702
19
5.2
18
77
10
99
64
0
7
28
1.20
89707808--89707912
53
2.0
53
86
0
147
35
11
15
38
1.83
89708252--89708307
25
2.2
25
84
12
71
37
16
5
41
1.71
89714395--89714549
52
3.0
52
79
10
190
25
16
27
29
1.97
89714409--89714605
46
4.0
47
76
10
126
23
17
29
29
1.97
89715343--89715380
20
1.9
20
94
0
67
23
34
31
10
1.89
89721762--89721900
52
2.7
53
85
6
178
26
17
27
28
1.98
89730099--89730252
67
2.3
68
80
10
172
33
15
27
22
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89731399--89731431
2
16.5
2
100
0
66
48
0
0
51
1.00
89732329--89733707
4
344.8
4
100
0
2758
25
0
24
50
1.50
89741921--89741950
2
15.0
2
92
0
51
46
0
3
50
1.18
89744342--89744501
40
4.0
40
92
0
257
28
30
21
20
1.98
89746596--89746625
2
15.0
2
92
0
51
46
0
3
50
1.18
89748542--89748609
6
12.8
5
76
14
50
76
1
5
16
1.05
89748562--89748611
11
4.3
12
73
16
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2
4
16
1.00
89748562--89748629
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11.5
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1
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16
1.05
89748542--89748604
23
2.7
23
82
9
65
76
1
6
15
1.07
89748542--89748632
29
3.1
29
79
17
91
75
1
6
16
1.06

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378