Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  217  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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118
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1.95
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1.83
64525904--64526267
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21
8
28
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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1.82
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1.96
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232
28
29
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1.98
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232
28
23
19
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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28
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23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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A
C
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(0-2)
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48
86
6
781
33
9
28
28
1.88
64623737--64624271
96
5.6
96
92
2
876
33
8
28
28
1.87
64624266--64624395
48
2.7
48
96
0
233
31
6
30
31
1.84
64624435--64624525
37
2.4
37
96
1
164
23
18
32
25
1.97
64631708--64631808
39
2.5
40
85
1
132
30
22
24
21
1.99
64631708--64631890
40
4.6
40
82
3
181
27
22
26
23
1.99
64633521--64633820
40
7.5
40
86
5
324
24
20
28
26
1.99
64637365--64637539
39
4.5
39
80
7
158
28
22
25
24
2.00
64645423--64645523
39
2.5
40
85
1
132
30
22
24
21
1.99
64645423--64645605
40
4.6
40
82
3
181
27
22
26
23
1.99
64645464--64645650
80
2.3
80
79
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189
24
22
29
24
1.99
64648671--64648739
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
64648662--64648749
30
3.0
30
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8
99
10
17
15
56
1.66
64651113--64651288
46
3.8
45
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11
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20
18
30
30
1.97
64651109--64651280
93
1.8
93
91
2
283
20
19
30
29
1.97
64654250--64654318
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15
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0
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13
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11
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1.64
64654250--64654329
15
5.4
14
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4
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11
17
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58
1.62
64656708--64656883
46
3.8
44
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10
165
21
20
28
29
1.98
64656704--64656875
93
1.8
93
88
0
263
20
20
29
28
1.98
64670559--64670617
29
2.0
29
100
0
118
27
10
30
32
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64674061--64674101
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2.7
16
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14
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2
29
0
68
1.03
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33
1.9
32
83
9
81
29
17
25
27
1.98
64681422--64681464
24
1.9
24
86
13
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69
4
4
20
1.25
64681745--64681838
40
2.3
40
94
0
161
40
4
20
35
1.72
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49
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2
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33
10
29
27
1.90
64693112--64693228
40
2.9
40
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0
189
26
20
27
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1.99
64696832--64696902
22
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22
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18
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14
29
25
1.94
64696807--64697120
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9
29
27
1.89
64698916--64699107
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24
23
27
24
2.00
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24
24
1.77
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20
2.3
20
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24
18
22
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40
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169
25
21
27
25
1.99
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2
16.5
2
100
0
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0
0
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1.00
64710015--64710120
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2.1
50
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0
203
38
5
27
28
1.79
64710086--64710157
35
2.1
35
100
0
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40
8
25
26
1.83
64710121--64710252
48
2.8
48
97
0
246
35
6
28
29
1.83
64710036--64710205
83
2.0
84
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2
306
38
7
26
28
1.82
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78
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24
20
27
27
1.99
64711748--64712030
40
7.2
40
90
6
420
24
20
27
27
1.99
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28
3.5
28
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2
15.5
2
100
0
62
48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64715485--64715590
50
2.1
50
98
0
203
38
5
27
28
1.79
64715556--64715627
35
2.1
35
100
0
144
40
8
25
26
1.83
64715591--64715722
48
2.8
48
97
0
246
35
6
28
29
1.83
64715506--64715675
83
2.0
84
95
2
306
38
7
26
28
1.82
64718870--64718905
14
2.7
14
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12
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30
0
0
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0.89
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12
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5
0
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1.20
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19
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0
0
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1.9
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83
6
146
29
7
11
51
1.65

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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