Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  359  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Period
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Indices
Period
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Copy
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19
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20
21
33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.67
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15
85
37
3
1
57
1.23
107823819--107823939
50
2.4
52
82
8
133
38
3
2
56
1.29
107823959--107824017
25
2.5
24
78
10
68
33
8
6
50
1.59
107823975--107824023
25
2.0
25
91
0
80
34
8
6
51
1.57
107824178--107824225
16
3.1
15
90
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69
31
2
2
64
1.16
107824178--107824229
8
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30
1
1
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1.14
107827066--107827098
16
2.0
17
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5
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12
0
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107835771--107835825
27
2.0
27
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1
7
21
1.23
107835966--107836084
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100
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1
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28
1.32
107835971--107836010
20
2.0
21
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5
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57
2
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27
1.48
107840071--107840116
23
2.0
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12
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10
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107840672--107840788
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2.0
69
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0
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25
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107864224--107864264
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2.0
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29
1.98
107868405--107868490
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3.0
28
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12
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1
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1.37
107871744--107871828
43
2.0
43
100
0
170
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2.0
23
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0
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23
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28
1.84
107873896--107873968
33
2.2
33
95
4
130
54
5
17
21
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107874893--107874934
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2.3
18
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0
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21
2
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1.25
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11
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0
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0
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0
0
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0
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0
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0
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2
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0
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0
2
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30
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12
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17
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1
3
30
1.18
107911891--107911973
18
4.6
18
78
14
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1
3
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1.17
107911889--107911974
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27
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1
3
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1
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1.32
107912308--107912377
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0
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0
0
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68
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23
27
2.00
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132
6.6
130
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1089
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21
22
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107914363--107915038
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22
35
1.96
107914094--107915036
43
21.7
43
72
9
452
20
21
21
36
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107914188--107915047
259
3.3
260
91
3
1297
20
21
22
36
1.95
107915100--107915226
66
1.9
66
96
0
236
35
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19
33
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16
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0
0
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107916368--107916404
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8
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0
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0
0
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2
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0
0
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1
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1.17
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12
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1
3
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1.18
107922034--107922116
18
4.6
18
78
14
73
65
1
3
30
1.17

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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