Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  62  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15898954--15899071
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2.2
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1.99
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4.3
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0
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15955846--15955906
6
10.2
6
82
7
70
63
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3
22
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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1.8
182
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20
21
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1.98
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20
21
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1.98
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2.2
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20
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2
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1.54
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71
28
0
15
56
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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458
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23
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1.42
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7.1
26
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278
29
22
20
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16088916--16088999
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3.1
27
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3
134
20
26
22
30
1.98
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12.4
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20
41
1.83
16089151--16089355
27
7.7
26
78
4
194
29
9
19
41
1.82
16089321--16089504
54
3.4
54
87
0
179
38
7
21
32
1.82
16089339--16089515
81
2.2
81
85
0
246
37
7
22
32
1.82
16089348--16089504
27
5.8
27
89
0
215
39
7
22
29
1.82
16089348--16089504
81
1.9
81
90
0
251
39
7
22
29
1.82
16092044--16092082
20
2.0
20
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9
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2
25
17
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1.56
16097496--16097564
28
2.5
28
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2
122
43
27
10
18
1.82
16103798--16103835
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
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1.50
16105461--16105528
28
2.5
27
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4
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44
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10
19
1.82
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2.5
28
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2
122
43
27
10
18
1.82
16109999--16110177
89
2.0
89
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0
322
35
23
7
32
1.84
16114902--16115109
40
5.2
40
85
4
269
24
20
27
27
1.99
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21
2.5
22
78
9
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24
20
16
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1.93
16121747--16121902
78
2.0
78
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2.0
21
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48
0
2
48
1.14
16123443--16123477
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1.9
18
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0
2
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1.12
16123974--16124024
8
6.4
8
75
8
50
66
3
0
29
1.09
16123974--16124021
24
2.0
24
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4
60
64
4
0
31
1.12
16125830--16126036
53
3.8
53
75
5
200
38
17
24
19
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16140922--16140967
24
1.9
24
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0
56
73
0
17
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1.07
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29
6.5
29
84
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26
15
30
26
1.96
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40
4.2
40
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5
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25
27
20
25
1.99
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2
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2
100
0
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0
0
50
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0
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0
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1.00
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4
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45
1.52
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58
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38
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2.0
17
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24
0
12
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1.28
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19
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0
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4.9
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1
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59
1.25
16201676--16201727
18
2.9
18
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1
3
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1.27
16201684--16201749
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1.9
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82
17
82
33
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6
54
1.50
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0
0
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0
0
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0
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0
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0
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1.00
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1.63
16212114--16212164
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25
100
0
102
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15
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19
2.3
19
96
0
79
31
4
31
31
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16212616--16212674
19
3.3
18
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1
0
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1.10
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100
0
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0
0
34
0.93
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2.1
25
100
0
106
32
0
11
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24
2.2
25
84
9
69
52
0
1
45
1.11
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21
2.0
20
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58
0
0
41
0.98
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2.0
46
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0
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5
32
34
1.80
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13
100
0
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1
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7
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27
2.3
27
91
0
97
27
16
16
40
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378