Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  277  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83347730--83347796
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1.82
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20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
83359937--83360005
28
2.5
28
95
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122
43
27
10
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1.82
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29
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94
2.3
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297
29
20
28
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1.98
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1.97
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1.97
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15.7
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308
25
29
17
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1.97
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2.1
331
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1.97
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2.5
50
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1.98
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18
28
1.98
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5.5
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186
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17
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1.97
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7.9
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12
222
24
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1.98
83400294--83400653
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309
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30
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27
1.98
83405315--83405363
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2.8
18
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22
50
24
18
22
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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25
1.99
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24
18
22
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1.96
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4.2
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25
21
27
24
1.99
83417549--83417597
17
2.8
18
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22
50
24
18
22
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1.96
83418419--83418585
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4.2
40
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21
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1.99
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0
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25
14
28
1.95
83478267--83478420
29
5.5
28
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145
31
25
14
28
1.95
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55
1.9
55
100
0
208
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13
26
1.92
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12
2.5
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51
24
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0
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25
39
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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Indices
Period
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A
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(0-2)
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20
2.0
20
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15
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35
1.85
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43
2.2
42
88
1
136
25
28
23
23
1.99
83613768--83613796
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
83614030--83614140
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4.6
25
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17
72
43
23
1
31
1.64
83614345--83614506
41
4.0
41
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231
19
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83614511--83614565
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2.0
28
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20
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83615398--83615438
3
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5
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65
0
0
34
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39
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39
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41
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29
1.84
83622759--83622813
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2.6
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0
101
21
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25
16
1.94
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2.0
441
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1721
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7
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1.82
83635563--83635637
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2.0
37
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0
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29
32
17
21
1.96
83635685--83636310
48
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48
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0
993
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26
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35
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14
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12
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1.81
83639579--83639634
29
1.9
30
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17
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2
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10
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17
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17
0
28
1.44
83643865--83643916
23
2.4
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6
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53
17
0
28
1.44
83643882--83643936
27
1.9
29
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10
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54
18
0
27
1.44
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17
1.9
17
100
0
66
42
27
6
24
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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0
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26
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2
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0
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0
0
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1.00
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2.0
75
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28
10
18
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1.83
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35
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20
13
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1.89
83657595--83658242
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20
13
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1.90
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75
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20
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1.91
83657629--83658268
37
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20
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1.91
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2.0
21
100
0
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1.56
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100
0
202
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0
0
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53
0
0
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1.00
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21
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17
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27
27
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20.5
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0
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10
290
28
18
28
23
1.98
83691536--83691799
140
1.9
141
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29
18
28
23
1.98
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5.8
44
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11
200
20
30
21
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83695232--83695493
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2.8
92
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282
21
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20
27
1.98
83701867--83702130
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5.7
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239
27
17
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25
1.97
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2.0
68
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0
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27
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1
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2.3
24
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25
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4
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1.60
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20
2.1
19
85
9
53
2
28
17
51
1.59

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378