Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  356  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
26
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15
26
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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1.00
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Period
Size
Copy
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Size
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Indels
Score
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Entropy
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2
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20
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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201
33
24
10
31
1.90
106940657--106940828
75
2.4
73
84
8
226
33
23
11
31
1.90
106955257--106955307
22
2.3
23
80
10
61
54
0
0
45
0.99
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20
2.5
20
89
0
71
20
40
20
18
1.91
106965480--106965532
26
2.0
26
100
0
106
22
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11
50
1.75
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2
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2
100
0
74
48
0
0
51
1.00
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15
2.0
15
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0
51
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0
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20
22
13
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2
131
23
21
17
36
1.94
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0
35
1.07
106988868--106989012
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2.0
73
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19
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16
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0
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1.93
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1.93
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1.92
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1
3
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1.29
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2
17.0
2
87
6
50
54
0
0
45
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14
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0
0
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3
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0
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0
0
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1.90
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0
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18
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1.96
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19
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0
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20
17
1.60
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3.7
88
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35
21
17
25
1.95
107010835--107011162
180
1.8
176
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487
35
21
17
25
1.95
107011193--107011380
72
2.6
73
83
5
229
35
24
14
25
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107011423--107011555
71
1.9
71
91
0
221
32
22
15
30
1.94
107020255--107020294
10
4.0
11
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12
52
47
0
5
47
1.24
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2
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2
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0
57
48
0
3
48
1.17
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19
3.8
19
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96
5
0
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107020848--107020920
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0
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1.11
107020848--107020917
20
3.4
21
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99
5
0
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1.07
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0
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0
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2.0
27
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0
101
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14
12
30
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378