Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  86  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23313820--23313988
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7.0
24
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6
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27
22
21
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1.99
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20
3.0
20
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0
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20
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35
1.91
23315304--23315337
18
1.9
17
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5
59
64
8
17
8
1.47
23321689--23321750
30
2.1
30
90
0
97
25
24
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33
1.95
23321944--23322088
25
6.0
23
87
7
175
28
22
20
28
1.99
23321966--23322087
23
5.1
23
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3
181
29
22
20
27
1.98
23321966--23322087
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2.6
47
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183
29
22
20
27
1.98
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20
3.3
20
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0
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20
11
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1.90
23322138--23322193
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57
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19
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35
1.89
23323411--23323444
18
1.9
17
94
5
59
64
8
17
8
1.47
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22
2.5
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47
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3
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1.38
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22
2.2
20
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26
11
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1.29
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0
0
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6
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1.79
23345357--23345409
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
23352179--23352359
72
2.6
67
84
11
236
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2
7
28
1.38
23352308--23352411
44
2.3
46
87
8
153
58
1
9
29
1.41
23353640--23353677
18
2.2
18
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4
51
5
5
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1.13
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44
9.1
44
78
8
309
29
20
16
34
1.94
23353864--23354268
89
4.6
89
80
2
377
29
20
16
34
1.94
23353864--23354267
133
3.0
131
76
4
382
29
20
16
34
1.94
23356055--23356157
3
34.0
3
91
5
163
33
1
0
64
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23356328--23356380
12
4.3
12
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4
52
26
11
1
60
1.41
23356330--23356409
25
3.2
25
87
8
101
23
11
2
62
1.40
23356363--23356666
3
99.7
3
68
13
72
27
8
1
61
1.36
23356502--23356558
26
2.1
27
84
9
73
28
7
1
63
1.30
23356346--23356629
41
7.0
41
70
14
124
27
9
2
60
1.40
23356513--23356563
25
2.0
26
88
3
77
27
7
0
64
1.21
23356459--23356616
66
2.3
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79
8
151
26
9
2
61
1.40
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4
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0
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0
0
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15
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22
1
0
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0.88
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21
2.8
21
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22
1
0
76
0.88
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13
2.8
14
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53
20
2
0
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0.90
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15
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52
21
1
0
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15
2.0
15
93
0
51
50
0
10
40
1.36
23378179--23378358
34
5.1
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61
1
7
30
1.33
23378180--23378392
73
3.0
72
87
5
292
62
1
7
27
1.32
23381350--23381413
32
2.0
32
100
0
128
40
6
12
40
1.68
23385772--23385811
18
2.2
18
86
0
53
47
2
5
45
1.38
23386868--23386952
10
9.0
9
73
14
64
34
2
5
57
1.36
23386889--23386926
17
2.1
19
85
9
53
31
0
2
65
1.06
23387007--23387096
10
9.8
9
69
17
60
34
1
3
61
1.20
23387006--23387079
39
1.9
38
83
8
96
33
1
4
60
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23387064--23387095
15
2.1
16
94
5
57
37
0
0
62
0.95
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2
19.5
2
84
10
53
46
2
2
48
1.29
23405844--23405897
8
6.8
8
77
14
58
44
0
0
55
0.99
23405844--23405897
17
3.4
17
75
15
69
44
0
0
55
0.99
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31
2.0
31
100
0
124
41
0
0
58
0.98
23405847--23405889
23
1.9
22
90
4
68
41
0
0
58
0.98
23405857--23405905
14
3.3
14
73
15
53
40
0
0
59
0.98
23407859--23407969
47
2.3
49
81
9
140
34
2
5
57
1.36
23407880--23407980
48
2.1
48
80
8
109
36
2
3
56
1.33
23410262--23410302
18
2.3
18
91
4
66
65
4
7
21
1.37
23412131--23412383
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3.8
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77
12
207
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28
24
1.97
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15.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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9
23
1.58
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147
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24
16
31
1.97
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2.2
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208
27
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19
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1.98
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135
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24
1.98
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1.76
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16
2.5
17
81
11
52
58
9
9
23
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23434966--23434996
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15
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0
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0.79
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21
2.6
22
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10
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10
0
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19
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9
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0
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58
0
10
31
1.31
23443678--23444197
129
4.0
129
83
3
567
27
18
19
35
1.95
23448041--23448090
25
2.0
25
100
0
100
28
20
28
24
1.99
23454259--23454390
51
2.6
51
80
7
144
30
25
15
28
1.96
23480367--23480487
46
2.7
43
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12
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25
24
1.97
23480551--23480722
49
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47
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5
175
28
19
26
25
1.99
23487716--23487787
36
2.0
36
100
0
144
27
27
11
33
1.91
23495090--23495327
98
2.4
99
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5
304
24
18
27
29
1.98
23495090--23495319
49
4.7
49
82
4
257
24
18
27
29
1.98
23498327--23498365
15
2.6
15
95
0
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5
15
23
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1.59
23498327--23498395
30
2.3
30
80
7
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15
18
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1.56
23500620--23500834
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15
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25
20
26
26
1.99
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29
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25
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1.94
23500674--23500802
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26
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25
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27
27
1.99
23503376--23503581
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2.0
101
80
5
229
24
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27
28
1.98
23507403--23507445
17
2.4
18
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14
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20
0
6
72
1.08
23513227--23513391
60
2.8
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188
20
16
15
47
1.82
23513730--23513857
59
2.2
56
86
8
168
43
12
21
22
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23513730--23513857
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4.4
28
80
10
150
43
12
21
22
1.86
23513943--23513979
18
2.0
19
89
5
58
56
5
0
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1.22
23513943--23513980
19
2.0
19
89
0
58
57
5
0
36
1.21
23514013--23514060
19
2.6
18
83
6
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64
4
2
29
1.23
23514013--23514060
18
2.7
18
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64
4
2
29
1.23
23514009--23514069
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1
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1.20
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0
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1.17
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19
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25
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25
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1.91
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2.2
26
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0
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26
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18
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18
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182
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1.81
23536960--23537101
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1
0
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16
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1
0
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26
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0
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4
0
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1.16
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83
83
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29
18
20
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26
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26
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0
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27
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27
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7
113
18
23
21
36
1.95
23555728--23555841
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2.1
54
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149
18
23
21
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41
4.7
40
90
4
267
36
20
22
20
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23557625--23557815
80
2.3
81
87
5
269
36
20
22
20
1.96
23557830--23557864
18
1.9
18
88
0
52
60
20
0
20
1.37
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48
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47
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207
50
28
0
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7
7.0
7
78
0
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26
2
26
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2.0
21
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7
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1
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1.73
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37
4.5
37
94
0
269
13
49
13
23
1.78

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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