Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  274  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82403684--82403847
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4.1
40
82
6
188
25
20
28
26
1.99
82411832--82412009
80
2.2
80
83
4
209
25
20
27
25
1.99
82422157--82422233
40
1.9
40
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2.1
14
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1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
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(0-2)
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82458921--82459053
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2.5
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180
36
0
19
43
1.57
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2.0
43
92
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112
29
25
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50
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17
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66
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23
0
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2.3
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21
0
76
0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.11
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1.90
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1.99
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3.2
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24
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80
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3.9
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22
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234
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20
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1.99
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25
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244
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11
1007
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9
7
45
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82592250--82592692
233
1.9
223
84
4
571
36
9
8
45
1.67
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491
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1093
37
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7
45
1.65
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40
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3
323
25
28
22
23
1.99
82599862--82600067
78
2.6
80
92
3
330
26
28
21
23
1.99
82605490--82605523
9
3.7
9
88
7
50
29
0
47
23
1.52
82605583--82605644
28
2.2
28
97
0
115
53
9
8
29
1.62
82608350--82608517
40
4.2
40
80
3
187
25
22
26
25
2.00
82611563--82611589
13
2.1
13
100
0
54
14
14
0
70
1.17
82611578--82611632
26
2.1
27
96
3
103
27
7
10
54
1.61
82615290--82615319
15
2.0
15
93
0
51
43
26
3
26
1.70
82623867--82623915
20
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21
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16
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71
10
10
8
1.31
82624795--82624823
8
3.8
8
90
9
51
13
0
0
86
0.58
82624795--82624823
15
1.9
15
100
0
58
13
0
0
86
0.58
82624997--82625022
11
2.4
11
100
0
52
19
7
0
73
1.07
82630568--82632186
94
17.3
94
81
3
1526
33
17
20
28
1.95
82631058--82631400
50
7.2
50
66
20
164
31
16
19
31
1.95
82635162--82635314
50
3.2
48
71
20
140
37
17
16
27
1.92
82635212--82635358
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3.2
44
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19
111
38
17
16
27
1.91
82635134--82636338
94
12.8
94
82
1
1234
34
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19
28
1.95
82637850--82637886
8
4.8
8
96
3
67
21
0
0
78
0.75
82640616--82640766
29
5.2
29
83
3
205
37
15
24
22
1.93
82650586--82650792
57
3.6
56
80
7
220
29
15
21
32
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
95
98
0
371
30
10
21
37
1.87
82652477--82652517
18
2.3
18
91
0
64
43
17
7
31
1.76
82652538--82652578
6
6.5
6
83
10
55
19
0
2
78
0.87
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13
1.9
13
100
0
50
12
0
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40
1.40
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2.1
18
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0
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10
2
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1.52
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2
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2
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0
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0
0
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1.00
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3
0
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1.13
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26
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1.47
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2.0
21
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0
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21
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1.98
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29
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1.9
132
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1.98
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1.9
176
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500
28
20
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27
1.99
82682571--82682798
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5.2
44
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129
29
20
23
26
1.99
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30
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0
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1.25
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24
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1.9
22
90
0
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54
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19
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3
100
0
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0
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5
5
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2.1
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5
178
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30
1.50
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17
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0
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4
26
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23
4.2
22
77
13
81
24
18
19
37
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82708879--82708968
3
30.7
3
89
4
121
61
0
4
34
1.16
82711334--82711401
28
2.5
26
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13
64
7
23
0
69
1.14
82712411--82712454
6
7.3
6
78
0
52
22
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52
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82712419--82712449
12
2.6
12
100
0
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22
9
9
58
1.59
82725017--82725564
302
1.8
300
85
6
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31
10
17
40
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82728891--82728946
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2.0
28
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0
103
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0
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29
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0
0
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0
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0
0
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2.0
39
97
0
149
25
30
18
25
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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