Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  321  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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2.1
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Period
Size
Copy
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Score
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26
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1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
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Period
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A
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(0-2)
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25
1.99
97815861--97815944
26
3.2
26
96
0
150
33
4
25
36
1.77
97817429--97817482
26
2.1
26
86
6
74
37
22
14
25
1.93
97817730--97818016
137
2.1
137
98
0
547
24
18
25
31
1.98
97819150--97819249
34
3.0
33
75
20
100
35
3
12
50
1.55
97820378--97820440
17
3.7
17
71
0
54
31
11
12
44
1.78
97820486--97820531
18
2.6
18
82
0
56
26
10
19
43
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97826686--97826802
62
1.9
60
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5
155
48
5
3
42
1.42
97826781--97826871
32
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35
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13
134
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6
1
42
1.36
97826805--97826854
15
3.2
15
72
10
55
46
10
0
44
1.37
97829449--97829628
49
3.7
49
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6
152
23
29
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24
1.99
97829453--97829628
98
1.8
97
83
3
237
23
28
22
25
1.99
97829730--97829853
46
2.7
46
89
0
203
25
27
19
28
1.99
97829682--97829853
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1.9
91
84
9
233
23
28
19
28
1.98
97831309--97831398
18
4.9
18
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5
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37
12
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1.83
97831881--97831940
17
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17
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33
1
0
65
1.03
97831882--97831940
16
3.5
16
76
23
59
33
1
0
64
1.04
97831917--97831966
26
1.9
26
83
0
64
36
4
0
60
1.16
97842936--97842987
25
2.1
25
82
7
61
57
5
0
36
1.23
97844640--97844671
15
2.1
15
94
0
55
68
9
6
15
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97846303--97846386
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2.6
32
75
5
78
36
11
20
30
1.89
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103
2.2
101
80
4
244
31
16
24
27
1.97
97850368--97850552
103
1.8
101
84
2
253
34
16
20
28
1.94
97850505--97850576
33
2.2
32
80
7
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34
19
22
23
1.96
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2
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2
100
0
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0
0
51
1.00
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2.0
47
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0
179
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1.90
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14
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0
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2.0
21
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19
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1.92
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26
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51
2
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1.16
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19
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1.99
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57
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1
207
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1.91
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49
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167
25
17
27
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1.98
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2.0
31
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0
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5.2
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240
24
22
27
25
2.00
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5.1
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1.99
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2.3
27
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0
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27
26
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1.76
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14
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0
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0
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260
24
22
28
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2.1
12
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0
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0
0
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9
3.3
9
90
9
51
82
0
0
17
0.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97929079--97929135
25
2.3
25
96
0
105
54
8
3
33
1.48
97930759--97930903
27
5.4
27
88
0
173
39
17
19
23
1.92
97934664--97934886
79
2.8
80
83
8
283
25
21
26
26
1.99
97934664--97934888
119
1.9
120
82
9
291
24
21
27
26
1.99
97934665--97934888
40
5.6
40
84
8
246
25
21
27
26
1.99
97934671--97934921
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3.2
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26
20
26
26
1.99
97941836--97941995
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1.9
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28
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1.98
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28
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25
22
15
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1.94
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24
6.0
24
90
5
200
26
22
21
28
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378